寫在前面 很久很久以前，各種原因，我寫過一個帖子，《零基礎(chǔ)-完全重現(xiàn)某個基因家族分析文章（的分析部分）》 https://www.jianshu...
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使用HMM進行基因家族鑒定？無人不能。 -
零基礎(chǔ)多物種間共線性分析首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來了極大的便利。作為生信小白，在做多物種間共線性分析時，嘗試了多種方法，苦...
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物種間共線性circos——作圖步驟早先寫過，但是有不少朋友還是在后臺留言，無法完全重復(fù)。我仔細(xì)看了之后發(fā)現(xiàn)，的確是我在有些細(xì)節(jié)上寫的不夠詳細(xì)。但是不想去完善了。畢竟tbtools...
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TBtools | 多圖合一至強版教程！進化樹 + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動子 + 基因結(jié)構(gòu) + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個功能可以說...
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基因家族分析四(繪制基因家族motif圖)一：搜索其他保守蛋白結(jié)構(gòu)域 需要準(zhǔn)備的文件有：NBS蛋白序列，TIR.hmm和RPW8.hmm 二：擬南芥NPS基因家族含有哪些motif 識別...
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用TBtools，快速高效實現(xiàn)基因組共線性分析與可視化， 贊！寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴，可以通過以下幾段內(nèi)容，了解一下，我為什么要費勁巴拉畫出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程（1）寫在前面：非常感謝CJ開發(fā)出如此強大的TBtools工具，作者詳細(xì)講解了基因家族的分析過程和意義，課程購買地址，講的很棒，可以試聽。 一共分為4...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(3)基因家族成員的進化分析2基因-共線性的定義與常見算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準(zhǔn)備（物種比對到自身的.blast文件，物種基因信息文件.gff文件），運行MCScan...
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簡潔 | 優(yōu)雅地整理 BLAST 比對結(jié)果寫在前面 用過 BLAST 進行基因功能注釋的朋友應(yīng)該常常遇到兩個問題： BLAST 輸出格式較多，選擇哪一類輸出格式更為實用？ 輸出結(jié)果信息較...
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熱圖 | TBtools Heatmap 從入門到精通
寫在前面 2021年，新年第一天，我在忙著家里事情的間隙，分成五次（每次大概30min），錄制了 TBtools 的熱圖（Heatmap）功能的...
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