42篇文章 · 18472字 · 9人關注
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一致性基因組提取軟件-ANGSD安裝與使用
ANGSD軟件可以基于比對好的bam文件，提取得到與比對用的參考基因組一致性的基因組，有了一致性基因組，可以根據(jù)對應參考基因組的gff3文件提取...
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phyluce軟件安裝與使用
超保守原件UCEs,(ultraconserved elements )，是在進化過程中，各個物種保留的一種保守序列，因此可以通過提取該類序列，...
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動物線粒體基因組注釋軟件MITOS2安裝與使用
MITOS2可用于注釋后生動物以及真菌等線粒體基因組注釋，主要注釋線粒體18個核心基因（atp6 atp8 atp9 cob cox1 cox2...
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PlantCARE預測植物啟動子-順式作用元件啟動子 啟動子是RNA 聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特異性結(jié)合和轉(zhuǎn)錄起始所需的保守序列，多數(shù)位于結(jié)構基因轉(zhuǎn)...
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一些常用小腳本記錄
記錄下小編自己可能用到的小腳本 （1）fasta轉(zhuǎn)phylip格式 用法：python fa2phy.py seq.fasta seq.ph...
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基因組及gff3注釋下載總結(jié)對于生信分析，經(jīng)常需要從各種網(wǎng)址下載基因組，小編在此分享一些下載經(jīng)驗， （1）參考文獻：對于一個科學研究者，可以直接找到研究物種已發(fā)表的基因組文...
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hifiasm軟件安裝與使用
HiFi測序以及hifiasm軟件的使用，目前是市場上二倍體動植物基因組組裝的最佳選擇，沒有之一，多倍體目前也是最佳選擇,也正因為HiFi跟hi...
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linux系統(tǒng)-界面配色分享
在linux系統(tǒng)創(chuàng)建新的賬號后，界面顯示基本上是黑白色的，這時需要添加顯示的色彩，小編這里分享自己的界面配色： 將下面兩行添加到~/.bashr...
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IBD分析軟件germline安裝與使用
Identity by Descent (IBD) ：同源相同片段，是在兩個及以上個體存在來源于同一祖先的、未發(fā)生重組的、完全相同的DNA片段，...
