linux環(huán)境下的軟件安裝

將miniconda下載到服務器上

下載網站

清華大學開源軟件鏡像站

選擇版本

輸入命令：uname -a確定自己的版本，然后在網站上選擇合適的版本
我的是Miniconda3-latest-Linux-x86_64

進入biosoft目錄

命令cd ~/biosoft,或者cd+b +Tab鍵自動填充

進入 biosoft.png

下載miniconda

命令wget+復制下載的網站鏈接

安裝

bash+安裝文件名

安裝miniconda3.png

安裝成功.png

激活

source ~/.bashrc命令激活conda
輸入conda conda list查看

conda命令.png

conda list.png

添加鏡像

# 使用中科大的鏡像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

鏡像.png

使用conda

安裝軟件

conda install fastqc -y

下載fastqc.png

查看 fastqc

fastqc --help

刪除 fastqc

conda renove

remove.png