學(xué)習(xí)小組Day-3筆記——?jiǎng)A圓

linux環(huán)境下的軟件安裝

將miniconda下載到服務(wù)器上

  • miniconda 清華
  • 查看服務(wù)器多少位 uname -a
  • 安裝最新版本
  • 復(fù)制下載鏈接 鏈接
  • 登錄服務(wù)器，進(jìn)入biosoft
    cd biosoft
    wget 鏈接

怎么安裝miniconda

  • bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  • 激活
    source ~/.bashrc
  • 輸入conda 出現(xiàn)滿屏信息說(shuō)明成功
  • 添加鏡像

使用中科大的鏡像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

  1. 查看服務(wù)器上安裝的所有軟件列表 conda list
  2. 安裝軟件 conda install fastqc -y
  3. 確認(rèn)fastqc軟件是否安裝成功 fastqc --help
  4. 卸載軟件 conda remove fastqc -y
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