有參轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)11-上傳轉(zhuǎn)錄組到NCBI

登錄NCBI>點(diǎn)擊submit>選SRA>選Project>點(diǎn)New submission

1 SUBMITTER

填寫(xiě)名字,郵件,no group,學(xué)校學(xué)院,街道郵編國(guó)家,continue

2 GENERAL INFO

填no BioProject, no BioSample,立馬釋放數(shù)據(jù)。

3 PROJECT INFO

填個(gè)title和description,no

4 BIOSAMPLE TYPE,填PLANT

5 BIOSAMPLE ATTRIBUTES,Use built-in table editor

開(kāi)始填表,sample name命名不要相似,組間要有明顯的區(qū)別,自己加一列replicate

6,SRA METADARA

use built-in table editor

6.5,安裝aspera看百度

7,file

選FTP or aspera command line file preload

點(diǎn)開(kāi)aspera command line upload instructions,下載key file,到服務(wù)器里面,一個(gè)新的文件夾里面只放我的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),注意轉(zhuǎn)錄組的名字要和上圖完全一樣。

7.1,等一段較長(zhǎng)的時(shí)間上傳完畢后,在網(wǎng)頁(yè)上選select preload folder,選擇上傳好的文件夾

7.2,最后勾選Autofinish submission,continue

8,收到郵箱信息,說(shuō)等審核過(guò)了就自動(dòng)釋放數(shù)據(jù)了,等兩天吧。之后在manage data里面可以看到工程號(hào)、樣本號(hào)和SRA號(hào)了。

最后一個(gè)轉(zhuǎn)錄組教程了,完結(jié)。

#萬(wàn)神殿

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