元朝時(shí)期，統(tǒng)治者著力奉行“籠絡(luò)人才,以文治國(guó)”文教政策，對(duì)創(chuàng)辦書(shū)院、 大興文教予以大力支持。元朝時(shí)期，忽必烈等對(duì)書(shū)院采取了保護(hù)政策，使得書(shū)院繼續(xù)保持繁榮的局面。

書(shū)院在元代的繁盛，也得益于漢人官僚的極力倡導(dǎo)。仕元的漢人官僚，多是宋金時(shí)期參加科舉考試的飽讀詩(shī)書(shū)的讀書(shū)人。那些在理學(xué)思想浸潤(rùn)下的亡宋士大夫，一方面有著“為天地立心，為生民立命，為往圣繼絕學(xué)，為萬(wàn)世開(kāi)太平”的理想追求，另一方面，則通過(guò)創(chuàng)辦書(shū)院、書(shū)院講學(xué)等形式以實(shí)現(xiàn)其“以夏變夷”、征服“征服者”的潛在目的。

由于政策上的寬松和社會(huì)上普遍的興學(xué)熱情的高漲，書(shū)院，在元代，得到了長(zhǎng)足的發(fā)展， 從而造就了一個(gè)“前不見(jiàn)于宋，后不見(jiàn)于明清”的書(shū)院發(fā)展的黃金時(shí)期。

原本缺少書(shū)院的北方。因?yàn)樯蠈诱呒s束的寬松，各級(jí)漢人官僚的提倡與支持，書(shū)院在元代獲得了前所未有的快速發(fā)展。元代時(shí)期理學(xué)北移，書(shū)院北傳。由于耶律楚材等一批漢化很深的人物的努力，蒙元統(tǒng)治者也比較注意搜羅漢人及漢化的士大夫、讀書(shū)人和理學(xué)著作，如楊惟中、姚樞、趙復(fù)等，并于燕京創(chuàng)立了太極書(shū)院。理學(xué)大師的北方講學(xué)，促進(jìn)了理學(xué)的進(jìn)一步擴(kuò)展，同時(shí)也帶動(dòng)了書(shū)院在北方的迅速發(fā)展。

元代長(zhǎng)時(shí)期不開(kāi)科取士，讀書(shū)人仕進(jìn)無(wú)門(mén)；“九儒十丐”的職業(yè)劃分，又使得文人社會(huì)地位低下。所以元代并未出現(xiàn)太多學(xué)術(shù)上的大師，但卻在中國(guó)基礎(chǔ)教育的普及，文化的擴(kuò)散上貢獻(xiàn)不少，這也為后來(lái)的、更加世俗化的明清小說(shuō)的出現(xiàn)與繁榮，奠定了一定的基礎(chǔ)。

大部分南宋士大夫，在理學(xué)思想的感召下，忍辱負(fù)重，毅然肩負(fù)起以夏化夷、征服“征服者”的重任，從而使“道統(tǒng)”不墜。這一個(gè)龐大的遺民群體，成為了元代書(shū)院發(fā)展的主導(dǎo)力量。元代統(tǒng)治者將民辦書(shū)院一律承認(rèn)，視為地方官學(xué)，授予主持人山長(zhǎng)、教授等職務(wù)，并通過(guò)管理財(cái)政以控制經(jīng)費(fèi)使用，購(gòu)置學(xué)田以掌握書(shū)院經(jīng)濟(jì)命脈，控制招生考試及生徒的去向等措施，完成書(shū)院的官學(xué)化過(guò)程。并在后來(lái)的執(zhí)行過(guò)程中，通過(guò)嚴(yán)格書(shū)院設(shè)立審批手續(xù)，官府委派山長(zhǎng)、恩賜年老下第舉人、山長(zhǎng)等，入官食祿、各類(lèi)學(xué)官如直學(xué)、山長(zhǎng)、學(xué)錄等任命，要報(bào)政府批準(zhǔn)，建立學(xué)官升遷、轉(zhuǎn)任制度等措施，將書(shū)院徹底完成官學(xué)化。

元朝政府通過(guò)為讀書(shū)人提供仕進(jìn)之階等，將原本私人性質(zhì)、有著獨(dú)立思想的學(xué)術(shù)教育機(jī)構(gòu)，納入官僚化體系。書(shū)院的官學(xué)化削弱了學(xué)術(shù)創(chuàng)新，使書(shū)院?jiǎn)适Я俗陨淼奶攸c(diǎn)，書(shū)院教師則淪為了不入流的下級(jí)官吏。