在分子生物學(xué)研究領(lǐng)域,雙熒光素酶報告基因(Dual-LUC)實驗技術(shù)是應(yīng)用廣泛的核心實驗手段之一。
雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灱夹g(shù)以螢火蟲熒光素酶(Firefly Luciferase, FLuc)作為實驗報告基因,用于反映目標(biāo)調(diào)控元件的活性水平;以海腎熒光素酶(Renilla Luciferase, RLuc)作為內(nèi)參報告基因,可有效校正轉(zhuǎn)染效率、生理狀態(tài)等無關(guān)干擾因素,確保實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性。與傳統(tǒng)單熒光素酶檢測技術(shù)相比,Dual-LUC技術(shù)無需額外設(shè)置空白對照,操作簡便且靈敏度較高,同時可有效規(guī)避化合物自發(fā)熒光帶來的干擾,是分子機(jī)制研究中認(rèn)可度較高的技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制研究。
該技術(shù)無需進(jìn)行電泳、雜交等復(fù)雜操作,通過檢測熒光素酶催化底物產(chǎn)生的熒光信號,可精準(zhǔn)量化調(diào)控活性,實驗效率高、結(jié)果穩(wěn)定性強(qiáng)。
實驗流程
1. 載體構(gòu)建
2. 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌 GV3101感受態(tài)細(xì)胞
(1)取-80℃保存的農(nóng)桿菌待其部分融化,處于冰水混合狀態(tài)時插入冰中;
(2)每100 μL感受態(tài)加入0.01-1 μg質(zhì)粒DNA,依次于冰上靜置5?min、液氮5?min、37?℃水浴5?min、冰浴5?min;
(3)加入700?μL液體LB ,28℃振蕩培養(yǎng)2-3?h;
(4)6000 rpm 1min收集菌,留100?μL涂布于相應(yīng)抗生素的LB平板上,28℃培養(yǎng)2-3天。
3. 農(nóng)桿菌介導(dǎo)瞬時表達(dá)
(1)挑單克隆于5 mL LB 液體中,分別加50 μg/mL載體和農(nóng)桿對應(yīng)抗生素;28-30℃震蕩培養(yǎng);
(2)1 mL過夜培養(yǎng)農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)到25 mL LB液體培養(yǎng)基中(加對應(yīng)抗生素);
(3)4000 rpm 離心 10 min 收集菌體,棄上清;加入 1 mL 10 mM MgCl2重懸菌體,4000 rpm 離心10 min,棄上清;重復(fù)上述步驟3次;
(4)用浸潤緩沖液定容至OD600?= 1.2,按照不同組合,28℃黑暗培養(yǎng)2-3 h,按實驗組別將菌液等體積混合;
(5)選長勢良好的本氏煙,由上至下第3-?6片完全展開的真葉滲透接種農(nóng)桿菌;
(6)將農(nóng)桿菌注射到煙草葉片中,做好標(biāo)記;注射過后的植株培養(yǎng)36-48 h。
4. 煙草葉片熒光檢測
4.1 定性觀察
(1)通過Tanon活體成像系統(tǒng)分析待檢測樣品間的互作;
(2)用熒光素底物D-熒光素鉀鹽的反應(yīng)液噴濕葉片背面,黑暗處理7 min;
(3)將葉片置于Tanon活體成像儀中檢測發(fā)光情況。
4.2 定量檢測
(1)通過Opticsmate U6多功能酶標(biāo)儀定量分析待檢測樣品間的互作強(qiáng)度;
(2)通過打孔器取樣于2 mL離心管中,液氮冷凍后研磨;
(3)研磨后加100 μ?L裂解液,混勻后冰上放置5 min;
(4)13000 rpm 1 min,取20 μL 上清置于96孔酶標(biāo)板中,設(shè)置 6 孔重復(fù);
(5)根據(jù)試劑盒進(jìn)行相關(guān)操作并進(jìn)行數(shù)據(jù)分析;
一、轉(zhuǎn)錄因子-靶基因啟動子
轉(zhuǎn)錄因子與靶基因啟動子的特異性結(jié)合,是基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的核心環(huán)節(jié),Dual-LUC技術(shù)是驗證二者互作關(guān)系的經(jīng)典實驗方法,具有特異性高、結(jié)果可靠等優(yōu)勢。
??核心原理:將靶基因啟動子序列克隆至螢火蟲熒光素酶基因(FLuc)上游,構(gòu)建靶基因啟動子-Fluc重組報告載體;同時構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子過表達(dá)或沉默載體,共轉(zhuǎn)染至目標(biāo)細(xì)胞。若轉(zhuǎn)錄因子可與靶基因啟動子發(fā)生特異性結(jié)合,則會激活Fluc的轉(zhuǎn)錄表達(dá),使螢火蟲熒光強(qiáng)度顯著升高;若對啟動子上的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點進(jìn)行突變,熒光強(qiáng)度會出現(xiàn)明顯下降,據(jù)此可直接證實轉(zhuǎn)錄因子與靶基因的互作關(guān)系。
二、miRNA與靶基因
miRNA(microRNA)是一類長度約21–23?bp的內(nèi)源性非編碼RNA,被譽(yù)為基因表達(dá)的精細(xì)調(diào)控開關(guān)。在分子機(jī)制研究中,miRNA既是解析信號通路、解析疾病發(fā)生機(jī)理的關(guān)鍵分子,也是篩選分子標(biāo)志物、開發(fā)靶向干預(yù)策略的重要靶點,廣泛參與細(xì)胞增殖、分化、凋亡、發(fā)育時序與應(yīng)激響應(yīng)等核心生命過程。
? 核心原理:miRNA通過與靶基因mRNA的3’-UTR互補(bǔ)結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平抑制翻譯或促進(jìn)mRN降解,從而抑制熒光素酶的翻譯使熒光值降低。
三、轉(zhuǎn)錄因子活性鑒定
轉(zhuǎn)錄因子是基因表達(dá)的核心調(diào)控蛋白,其活性決定基因是否表達(dá)、表達(dá)強(qiáng)弱,進(jìn)而控制細(xì)胞命運、生理狀態(tài)、疾病發(fā)生,是生命調(diào)控的關(guān)鍵節(jié)點。
? 核心原理:將待測轉(zhuǎn)錄因子與GAL4結(jié)合域構(gòu)建在同一載體上,與含有GAL-TATA轉(zhuǎn)錄調(diào)控原件并帶有熒光蟲熒光素酶(FLuc)的表達(dá)載體共轉(zhuǎn),使這段序列調(diào)控Luciferase的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。通過檢測熒光值的高低可以判斷轉(zhuǎn)錄因子是否具有轉(zhuǎn)錄激活或者轉(zhuǎn)錄抑制作用。
四、啟動子活性鑒定
啟動子是位于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(TSS)上游的一段順式作用DNA調(diào)控元件,通常長度在幾百至數(shù)千bp,不編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列,而是通過提供RNA聚合酶、通用轉(zhuǎn)錄因子及特異性轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的結(jié)合位點,精確控制基因的轉(zhuǎn)錄起始效率、組織特異性、發(fā)育時序性與環(huán)境響應(yīng)性。
? 核心原理:將待測啟動子構(gòu)建至熒光素酶基因的上游,以螢火蟲熒光素酶(FLuc)反映待測啟動子的轉(zhuǎn)錄強(qiáng)度。
技術(shù)優(yōu)勢
體內(nèi)實驗:內(nèi)源性表達(dá),更真實的展示體內(nèi)的互作情況
高靈敏度:不受細(xì)胞內(nèi)其他物質(zhì)的影響
高準(zhǔn)確性:植物、哺乳動物中無報告基因內(nèi)源性表達(dá)
常見問題及解答
1. 熒光值過高或過低怎么辦
熒光值一般讀數(shù)在5-6位之間較好,若熒光值過高或過低可嘗試從以下方式解決:
(1)熒光值過高:
a、減少質(zhì)粒轉(zhuǎn)染量;
b、細(xì)胞樣品裂解后,離心取上清后檢測或?qū)α呀猱a(chǎn)物進(jìn)行稀釋后檢測。
(2)熒光值過低:
a、轉(zhuǎn)染效率低:優(yōu)化轉(zhuǎn)染實驗條件,確保轉(zhuǎn)染DNA的質(zhì)量;
b、樣品裂解效率低:細(xì)胞培養(yǎng)時間不宜過長,長時間培養(yǎng)后,細(xì)胞可能會難裂解;加入的裂解液需足量,裂解時間控制在24-48小時,保證細(xì)胞能夠充分裂解。
c、檢測過程操作不規(guī)范:應(yīng)室溫條件下反應(yīng),即各個組分包括細(xì)胞裂解液、底物工作液都需要調(diào)整至室溫
d、底物氧化失敗:底物避光密封保存,螢火蟲熒光素酶底物-20℃保存;海腎熒光素酶底物推薦-80℃保存;反應(yīng)工作液建議現(xiàn)用現(xiàn)配。
2. 復(fù)孔重復(fù)性差
報告基因檢測靈敏度高,影響因素多。除了引入另一個報告基因作為內(nèi)參照避免實驗條件變化的干擾之外,一般還需設(shè)置3個或3個以上復(fù)孔,應(yīng)盡可能減小復(fù)孔之間的差異性,復(fù)孔之間的數(shù)值有一定差異是正常的,一般認(rèn)為在同一個數(shù)量級的差異是可以接受的。
a、細(xì)胞裂解后建議離心取上清,保證樣本的均一性;
b. 保證加樣的準(zhǔn)確性,移液器需定期校準(zhǔn),確保移液精準(zhǔn);
3. 螢火蟲熒光素酶和海腎熒光素酶的區(qū)別
螢火蟲熒光素酶在氧氣、ATP和鎂離子同時存在的條件下,催化熒光素氧化,生成氧化熒光素,同時產(chǎn)生黃綠色光,波長540-600nm,一般檢測時選用560nm。海腎熒光素酶只需要氧氣就可以催化腔腸素氧化產(chǎn)生藍(lán)光,波長460-540nm,一般檢測時選用460nm。