一、下載miniconda

• Google搜索miniconda 清華，找到鏡像，點擊miniconda下載
• 用Xftp傳到Linux系統(tǒng)

二、安裝并激活miniconda

• 用bash命令 miniconda的安裝包，按照提示安裝；
• 激活miniconda，用source ~/.bashrc ,輸入conda,出現(xiàn)滿屏信息，說明激活成功；
• 添加鏡像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

三、使用miniconda

• 查看當(dāng)前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表
  命令 conda list
• 搜索conda軟件
  命令 conda search fastqc（這里查找的是質(zhì)控軟件fastqc）
• 安裝軟件
  命令 conda install fastqc -y
• 卸載軟件
  命令 conda remove fastqc -y

四、選修內(nèi)容

• conda 環(huán)境（分身）
• 查看當(dāng)前conda有哪些環(huán)境
  命令 conda info --envs
• 新建環(huán)境
  命令 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
  （新建一個rna-seq 基于python3的環(huán)境，并下載fastqc和trimmomatic這兩個軟件。）
• 激活新的conda環(huán)境
  命令 conda activate rna-seq
• 退出當(dāng)前環(huán)境
  命令 conda deactivate