1 安裝Miniconda
#下載安裝包
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate
#安裝miniconda
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
注意：
1) 使用“Enter”查看license agreement；
2）查看完license agreement后，需要輸入“yes”表示接受才能繼續(xù)；
3） 需要確認安裝路徑，可以使用”Enter鍵”確認安裝在根目錄（建議不更改）；
4）經過1-2分鐘安裝完成后，需要同意安裝器是否初始化miniconda，需要輸入“yes”同意后，miniconda的“PATH”才能加入到~/.bashrc 。
#讓添加miniconda路徑可執(zhí)行
source ~/.bashrc
2 設置國內鏡像
conda默認使用的國外鏡像源速度相對較慢，通常為了正常運行，會使用清華的鏡像。
如果不設置的話經常會出現(xiàn)這樣的報錯：CondaHTTPError: HTTP 000CONNECTION FAILED for url
#恢復conda的源為默認
conda config --remove-key channels
#添加國內鏡像
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/linux-64
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/linux-64
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/linux-64
#顯示channel地址
conda config --set show_channel_urls yes
#設置channel的優(yōu)先級別為彈性的
conda config --set channel_priority flexible
命令執(zhí)行完成后會形成：.condarc文件
#編輯.condarc文件
vim ~/.condarc
點擊insert進入編輯模式
刪除底部的-default，
點擊esc，退出編輯模式，然后輸入“：wq”退出
#查看源
conda config --show-sources
#清除索引緩存，保證使用的是鏡像站提供的索引
conda clean -i
3 安裝軟件包
#測試一下
conda search packagename
如果能正常顯示，應該可以正常安裝，安裝軟件包的命令可以去下面這個網站查看：
https://anaconda.org/anaconda/repo
如果安裝的時候出現(xiàn)問題，可以試試指定channel安裝軟件包：
conda install $package_name --channel http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/linux-64
