《Nature Communication》文章Endothelial RAB5IF is required for pathological and developmental retinal angiogenesis. Fig 5B （左圖）的漸變條形圖展示了蛋白組中上調(diào)蛋白的顯著富集條目。X軸是-log10(Pvalue)，Y軸是富集條目，條形顏色以-log10(Pvalue)進(jìn)行映射。文章DNA methylation predicts adverse outcomes of coronary artery disease. Fig 2C（右圖）以類似的圖展示富集結(jié)果，X軸是基因數(shù)，Y軸是富集條目，條形顏色以-log10(P)進(jìn)行映射。在條形圖上直接標(biāo)注文字，可以提升空間利用率、增強(qiáng)信息密度，并保持視覺上簡潔清新。
1，打開作圖URL
https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_gradient_bar_plot_286
2，示例數(shù)據(jù)
點(diǎn)擊圖片上方的示例數(shù)據(jù)，下載，并使用excel打開。
示例數(shù)據(jù)可以是三列或者四列。
三列時(shí)：第一列是富集條目；第二列是基因Count，第三列是富集的Pvalue或者FDR，Padj等，數(shù)據(jù)范圍必須是0-1，且不等于0。
四列時(shí)：第一列是富集條目；第二列是基因數(shù)Count，第三列是富集的Pvalue或者FDR，Padj等，數(shù)據(jù)范圍必須是0-1，且不等于0；第四列是分類，例如GO的BP,CC,MF。
如果按照第二列從大到小排序，則圖中條形從長到短（自上而下）；如果按照第三列P值從小到大排序，則圖中條形顏色從p值小的顏色漸變到p值大的顏色。
注：默認(rèn)以首行“第二列名字”作為X軸說明，若第二列數(shù)值是-log10轉(zhuǎn)換的值,且名字以-log10開頭，則以“-log10(第三列)”為X軸說明。
3，輸入檢查
示例數(shù)據(jù)：點(diǎn)擊輸入框下面的“示例1”按鈕，將載入3列的示例數(shù)據(jù)。
真實(shí)數(shù)據(jù)：數(shù)據(jù)放在excel中，調(diào)整好后，Ctrl+A選中數(shù)據(jù)，Ctrl+C拷貝，Ctrl+V將數(shù)據(jù)粘貼到輸入框中。
然后使用輸入框下面的“輸入檢查”按鈕先對(duì)輸入數(shù)據(jù)進(jìn)行檢查。若檢查不通過，請(qǐng)根據(jù)檢查提示重復(fù)【修改-輸入檢查】步驟，直到檢查通過（如下圖所示），然后可以繼續(xù)選擇其他參數(shù)。
注：輸入檢查是新添加的功能，它會(huì)根據(jù)不同模塊的輸入要求，逐行逐列檢查輸入數(shù)據(jù)，并給出提示，以確保數(shù)據(jù)符合模塊輸入要求。
4，選擇參數(shù)
提供了多種參數(shù)對(duì)圖像元素進(jìn)行修改，包括：
圖片大小
圖片寬度，高度。請(qǐng)根據(jù)富集條目數(shù)和條目文字長度進(jìn)行調(diào)整
顏色
P值大的顏色和P值小的顏色。
字體大小
提供了圖中所有文字的字體大小設(shè)置參數(shù)，包括：標(biāo)題（title）字體大小，bar上文字（輸入第一列）字體大小，X軸說明文字字體大小，X軸刻度字體大小，分類名字字體大小，圖例標(biāo)題字體大小，圖例刻度字體大小
Bar和標(biāo)題
設(shè)置了bar寬度，bar的透明度（alpha）參數(shù)
圖片標(biāo)題文字。留空則不顯示標(biāo)題
垂直grid線
X軸刻度處的垂直輔助線
字體：
設(shè)置了期刊雜志中最常用的兩種字體：Times New Roman和Arial
5，提交出圖
檢查通過，并且參數(shù)選好后，點(diǎn)擊“提交”按鈕，約1s后，會(huì)在頁面上顯示bar圖。我們提供了pdf、svg兩種矢量圖，png、tiff兩種標(biāo)量圖供大家下載使用。
可以使用acrobat illustrator等軟件編輯矢量圖（pdf或svg），進(jìn)行組圖，調(diào)整文字位置，字體，添加說明等操作，以滿足個(gè)性化需求。
2026，?；锇閭兛蒲许樌斂善?！
微生信助力高分文章，用戶340000+，谷歌學(xué)術(shù)8500+
