導(dǎo)讀：富集分析結(jié)果條目繁多，不同分組的條形不易區(qū)分。采用背景色分區(qū)，將各分組的條形置于不同色塊背景中，這一簡單優(yōu)化即可顯著提升視覺清晰度，方便快速對比與解讀。
《Nature Genetics》文章Dissecting the impact of transcription factor dose on cell reprogramming heterogeneity using scTF-seq. Fig 5g將不同分組的條形以淺色的矩形背景包裹，展示了3個cluster的GO富集分析結(jié)果。圖中X軸表示-log10(padj)，Y軸是富集條目，分成三部分：Cluster1低劑量、Cluster2中劑量、Cluster3高劑量的富集結(jié)果。垂直線表示顯著性閾值padj 0.05。
1，打開作圖URL
https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_go_horizontal_bar_with_labels_247
2，示例數(shù)據(jù)
點擊圖片上方的示例數(shù)據(jù)，下載，并使用excel打開。
示例數(shù)據(jù)包括4列：
第1列是分組信息，可以是GO的不同類別，或者不同的比較。最多繪制6組
第2列是條目名字
第3列是條目的富集p值（或者padj），在圖中以-log10的形式展示，表示bar長度
第4列是條目中與輸入基因交集的基因數(shù)
注：若沒有第4列，可以都寫1，然后繪圖時，選擇不標(biāo)注第4列即可
3，輸入檢查
示例數(shù)據(jù)：點擊輸入框下面的“示例”按鈕，將載入示例數(shù)據(jù)。
真實數(shù)據(jù)：數(shù)據(jù)放在excel中，調(diào)整好后，Ctrl+A選中數(shù)據(jù)，Ctrl+C拷貝，Ctrl+V將數(shù)據(jù)粘貼到輸入框中。
然后使用輸入框下面的“輸入檢查”按鈕先對輸入數(shù)據(jù)進行檢查。若檢查不通過，請根據(jù)檢查提示重復(fù)【修改-輸入檢查】步驟，直到檢查通過（如下圖所示），然后可以繼續(xù)選擇其他參數(shù)。
注：輸入檢查是新添加的功能，它會根據(jù)不同模塊的輸入要求，逐行逐列檢查輸入數(shù)據(jù)，并給出提示，以確保數(shù)據(jù)符合模塊輸入要求。建議每次提交前先進行輸入檢查。
4，選擇參數(shù)
圖片大小
設(shè)置了圖片寬度，圖片高度參數(shù)
文字及字體大小
X軸說明文字：取第3列第一行作為說明，并自動添加-log10()，例如第3列是pvalue，那么圖上X軸說明就是-log10(pvalue)
X軸說明字體大?。?log10(pvalue)的字體大小
Y軸條目說明字體大?。篩軸條目的字體大小
標(biāo)注基因數(shù)字體大小：bar右側(cè)標(biāo)注的第4列的基因數(shù)字體大小
分組字體大?。旱谝涣蟹纸M信息的字體大小
位置信息
分組信息X軸位置：定義分組信息的位置，負值，越小越靠左
背景左側(cè)X軸位置：背景矩形左側(cè)的位置，負值，越小越靠左
背景右側(cè)X軸位置：背景矩形右側(cè)的位置，正值，越大越靠右
注意：請配合3個位置信息，以完全覆蓋分組，條目和bar等信息
顏色
分組的顏色，設(shè)置了6種顏色，即最多繪制6組數(shù)據(jù)
新加功能：解決配色難題
1，顏色集：提供了7種論文的顏色集，點擊后，在該論文的顏色集中隨機挑選6種顏色
2，隨機顏色：點擊“隨機”按鈕后，會隨機推薦6種顏色，點擊一次，隨機一次
3，自定義：可以粘貼空格分隔的16進制顏色編號，例如 #E64B35 #4DBBD5 #00A087
其他
Bar高度：定義了bar的高度，數(shù)值越大，bar越粗
背景矩形透明度：背景的透明度，數(shù)值越小越透明（顏色越淺）
添加0.05的閾值線：是否需要添加0.05的閾值線（約1.3附近）
Bar上標(biāo)注最后一列數(shù)字：是否標(biāo)注第4列的數(shù)字
字體
設(shè)置了期刊雜志中最常用的兩種字體：Times New Roman和Arial。如需使用其他字體，可以下載pdf或者svg圖片，然后使用acrobat illustrator或者inkscape進行編輯修改
5，提交出圖
檢查通過，并且參數(shù)選好后，點擊“提交”按鈕，約2s后，會在頁面上顯示帶背景的分組bar圖。我們提供了pdf、svg兩種矢量圖，png、tiff兩種標(biāo)量圖供大家下載使用。
請使用Acrobat Illustrator，inkscape等軟件編輯矢量圖（pdf或svg），進行組圖，調(diào)整文字、圖像元素位置，字體，添加說明等操作，以滿足個性化需求。
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