說(shuō)在前面： 早在 2009 年，韓斌團(tuán)隊(duì)（第一作者是黃學(xué)輝）就在 Genome Res 上發(fā)了一篇文章 High-throughput genotyping by whole...
IP屬地：四川
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SNPbinner 構(gòu)建定位群體的基因組 bin 圖譜 -
手把手教你學(xué)生信系列（三）-- Linux 基礎(chǔ)入門(mén)攔路虎原本計(jì)劃這一篇介紹基礎(chǔ)命令的，然后我們微課學(xué)院之前已經(jīng)有相關(guān)錄制好的視頻，而且網(wǎng)上的相關(guān)文章多不勝數(shù)，因此也就不在賣弄了，簡(jiǎn)單交流一下 Linux 入門(mén)過(guò)程中的幾個(gè)攔路虎，具...
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Tassel 命令行版本使用筆記1. 常見(jiàn)的基因型數(shù)據(jù)格式 1.1 Hapmap 數(shù)據(jù)格式 1.2 VCF數(shù)據(jù)格式 VCF 包含9列，從第10列開(kāi)始為每個(gè)樣本信息。表頭##開(kāi)頭的為注釋信息，包含了 VCF ...
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WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號(hào)為KPGP-00001的數(shù)據(jù)。 先說(shuō)一下KPGP吧，中文名叫韓國(guó)個(gè)人基因組計(jì)...
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WGCNA關(guān)鍵模塊和hub基因篩選
WGCNA的理論背景知識(shí)[http://www.itdecent.cn/p/e102681ec979]WGCNA的詳細(xì)分析流程[https://www.jianshu.co...
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基因家族分析7 || 順式作用元件分析第六部分暫時(shí)發(fā)現(xiàn)一點(diǎn)問(wèn)題，改天補(bǔ)充~ 基因家族流程：基因家族分析（一）[http://www.itdecent.cn/p/34333a6d7c4e] 基因家族流程：基因家族...
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比較Hi-C數(shù)據(jù)分析的計(jì)算方法基于Hi-C數(shù)據(jù)的深層挖掘和多組學(xué)聯(lián)合分析已經(jīng)成為了三維基因組領(lǐng)域的重要組成部分。而工欲善其事必先利其器，夯實(shí)基礎(chǔ)方能壘砌高臺(tái)。染色質(zhì)構(gòu)象各個(gè)層級(jí)的識(shí)別和鑒定的準(zhǔn)確性會(huì)直接影...
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全基因組甲基化分析簡(jiǎn)述DNA甲基化是一種非?；A(chǔ)且重要的表觀修飾，在調(diào)控基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合和抑制轉(zhuǎn)座子元件中起到關(guān)鍵的作用。 目前，DNA甲基化檢測(cè)的技術(shù)已經(jīng)比較成熟，例如高通量的WGBS、R...
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Week 6 轉(zhuǎn)座子-轉(zhuǎn)座重組-分析轉(zhuǎn)座的實(shí)驗(yàn)http://mooc.guokr.com/note/19349/ Lecture 11: Mechanism of Transposition轉(zhuǎn)座機(jī)制 Segment 1:...
