blat下載和安裝

wget https://users.soe.ucsc.edu/~kent/src/blatSrc35.zip
unzip blatSrc35.zip
cd blatSrc/
uname -a
export MACHTYPE=x86_64
mkdir -p ~/bin/x86_64
make

make報(bào)錯(cuò)了

make[1]: Entering directory `/home/micro/software/blatSrc/lib'
gcc -O -g  -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_LARGEFILE_SOURCE -D_GNU_SOURCE -DMACHTYPE_x86_64   -I../inc -I../../inc -I../../../inc -I../../../../inc -I../../../../../inc  -o pngwrite.o -c pngwrite.c
pngwrite.c:7:87: fatal error: png.h: No such file or directory
 #include "png.h"   // MUST come before common.h, due to setjmp checking  in pngconf.h 
                                                                                       ^
compilation terminated.
make[1]: *** [pngwrite.o] Error 1
make[1]: Leaving directory `/home/micro/software/blatSrc/lib'
make: *** [all] Error 2

看來(lái)時(shí)缺依賴
yum install libpng #我是centos系統(tǒng)
安裝不了這個(gè)包,,非常幸運(yùn)找到這個(gè)網(wǎng)站,告訴我blat安裝的依賴
http://genome.ucsc.edu/goldenPath/help/mirrorManual.html#software-requirements
顯示:

Debian/Ubuntu: apt-get install ghostscript apache2 mysql-server gmt r-base uuid-dev python-mysqldb
Redhat/Fedora/CentOS: yum install libpng12 httpd ghostscript GMT hdf5 R libuuid-devel MySQL-python

所以直接安裝:
yum install libpng12
安裝成功!
最后輸入make安裝成功

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容