發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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2023-07-11 crossMap不同版本基因組位點(diǎn)坐標(biāo)轉(zhuǎn)換
CrossMap[https://crossmap.sourceforge.net/#installation] installation do...
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2023-06-14 perl中模式匹配后使用pos()返回匹配位置的問(wèn)題
總結(jié)：如果使用全局修飾符/g，那么下次匹配會(huì)從上次匹配的中止位置開(kāi)始；而不是從0開(kāi)始；所以在做if篩選條件【if(base2=~/TACG/ )...
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2023-06-09 scRNA-seq分析個(gè)人分析記錄貼
前言 scRNA-seq越來(lái)越成為一種常規(guī)測(cè)序內(nèi)容，最近正好分析一些scRNA-seq的數(shù)據(jù)，把分析過(guò)程記錄下來(lái)，便于后續(xù)再次使用。對(duì)于走過(guò)的坑...
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2023-05-31 windows下Docker的安裝
下載DockerDownload Docker Desktop | Docker[https://www.docker.com/products...
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2022-11-14 bigwig文件轉(zhuǎn)換為bed文件在數(shù)據(jù)分析的時(shí)候經(jīng)常碰到各種文件格式的相互轉(zhuǎn)換，UCSC[http://genome.ucsc.edu/util.html]提供了一些工具。去A...
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2022-10-10 samtools分析測(cè)序基因組的depth和coverage
對(duì)基因組測(cè)序完成后，我們經(jīng)常需要統(tǒng)計(jì)測(cè)序深度（depth）和對(duì)基因組的覆蓋率（coverage） 這兩個(gè)概念有時(shí)候不太好區(qū)分，有時(shí)coverag...
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2021-10-26 RNA-seq分析個(gè)人記錄帖
a.整體流程及相關(guān)軟件 數(shù)據(jù)資源下載，參考基因組及參考注釋組 數(shù)據(jù)質(zhì)控及相關(guān)軟件fastp (代替fastqc，multiqc， trimmom...
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2021-08-23 ChIP-seq數(shù)據(jù)分析流程（從頭到尾）
傳送門(mén)[http://www.itdecent.cn/p/96688fecd864]
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2021-08-09 MAnorm差異分析-一款尋找兩個(gè)ChIP-Seq樣本之間差異peak的軟件
3.2 第二種方式MAnorm差異分析-一款尋找兩個(gè)ChIP-Seq樣本之間差異peak的軟件 軟件網(wǎng)址：https://manorm.read...
個(gè)人介紹
專(zhuān)注WGBS Chipseq等數(shù)據(jù)分析
perl python R腳本編輯處理數(shù)據(jù)
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