探序基因腫瘤研究院 整理 作者安裝好了centos8，并安裝了R-4.3.2，通過install.paclages("Seurat")自動安裝Seurat包。運(yùn)行了很久很久后...
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Seurat包安裝問題
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WGCNA分析教程五 | [更新版]一邊學(xué)習(xí)，一邊總結(jié)，一邊分享！ 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代碼 | 代碼一[https://mp.weixin.qq.com/s/M0LAlE-6...
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Rstudio Server 安裝配置 說明
一.安裝 RStudio Server RStudio下載地址：http://rstudio.org/download/[http://rstudio.org/downloa...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析—Salmon定量salmon是一款不基于比對而直接對基因進(jìn)行定量的工具，適用于轉(zhuǎn)錄組、宏基因組等分析。其優(yōu)勢是： 定量時考慮到不同樣品中基因長度的改變（比如不同isoform的使用） 速度快...
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安裝SyRI過程中遇到的glibc沖突
使用官方推薦的安裝命令 產(chǎn)生如下奇怪的glibc沖突 可是明明2.31大于2.17版本啊，經(jīng)過查閱，發(fā)現(xiàn)可能是conda同時搜索conda-forge和default庫產(chǎn)生沖...
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使用AnnotationForge包自定義Orgdb包參考1：http://www.itdecent.cn/p/68f7b663c5ff[http://www.itdecent.cn/p/68f7b663c5ff]參考2：h...
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Ph.D in Xiamen University.<br>Hiplot: <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fhiplot.cn" target="_blank">https://hiplot.cn</a><br>OmicsSuite: <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fgithub.com%2Fomicssuite" target="_blank">https://github.com/omicssuite</a><br>Github: <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fgithub.com%2Fbenben-miao" target="_blank">https://github.com/benben-miao</a>
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BioSciTools: bioinformatics desktop softwareBioSciTools https://bioscitools.github.io[https://bioscitools.github.io]基于Java (JDK-11)...
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轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切 STAR比對的特點(diǎn)： 速度快 準(zhǔn)確度高 3'reads soft clip genomeLoad LoadAndKeep 多個比對共享...
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哺乳動物器官中基因表達(dá)水平的進(jìn)化
The evolution of gene expression levels in mammalian organs[https://pubmed.ncbi.nlm.nih...
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【名詞解釋】synteny / collinearity / identity / similarity / homology1. synteny 和 collinearity 用來描述基因組的共線性 synteny 共線性：同源基因在相應(yīng)染色體上的保留collinearity 同線性：在synte...
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【文獻(xiàn)分享】棉纖維單細(xì)胞晝夜節(jié)律機(jī)制研究今天分享最近發(fā)表的另外一篇文獻(xiàn)，還是棉花棉纖維研究的，最近棉花的單細(xì)胞文章還真是多，扎堆發(fā)表了。 棉纖維的重要性，我就不多做敘述了，我也查百度，就不粘貼了。circadida...
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物種進(jìn)化樹構(gòu)建
使用單拷貝基因畫物種進(jìn)化樹 所需軟件： 步驟： python 腳本更改物種蛋白序列的ID 2)更改各個物種蛋白庫文件的名字，與序列ID的名字前半部分一致；例如Amborell...
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復(fù)現(xiàn)SCI文章：配對連線、散點(diǎn)箱線圖今天我們要復(fù)現(xiàn)的是一篇SCI文章的配對連線箱線圖，配對箱線圖、或者說配對連線圖我們之前有寫過（ggplot做分組配對連線圖[http://mp.weixin.qq.com/s...
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【期刊】Rstudio 制作學(xué)術(shù)期刊圖片
參考：zhuanlan.zhihu.com/p/27162794 www.cookbook-r.com/Graphs/Output_to_a_file/ blog.scien...
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基因功能研究之蛋白實(shí)驗(yàn)
中心法則： 蛋白相關(guān)實(shí)驗(yàn)： 基因結(jié)構(gòu)： 研究思路： https://www.bilibili.com/video/BV1Sv4y117ZP/?spm_id_from=page...
