起源于五年前的一篇cell,又被喚醒于2024年的一篇nature medicine。兩篇文章這個(gè)圖都是關(guān)于WGCNA后續(xù)結(jié)果的展示,勝在這個(gè)網(wǎng)...
我們之前在python中1:1復(fù)刻R版火山圖之后(【1:1復(fù)刻R版】python版火山圖函數(shù)一鍵出圖),群里小伙伴希望使用python復(fù)刻之前c...
R版本的NMF分析中,我們介紹了相關(guān)概念,可查看((視頻教程)NMF: 單細(xì)胞非負(fù)矩陣分解R語(yǔ)言版-數(shù)據(jù)降維及MetaProgram分析)。但是...
起源是我們微信群里的小伙伴發(fā)了一張熱圖,需要讓我復(fù)現(xiàn),是一篇Cancer cell的文章,因?yàn)槲覀儗戇^很多熱圖,所以對(duì)這個(gè)圖無感,原因是看似復(fù)雜...
circle plot精彩系列: Circular Plot系列(一): 環(huán)形熱圖繪制Circular Plot系列(二): 學(xué)習(xí)nature子...
玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞往期精彩系列: 玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞(1)---提取特定基因表達(dá)的細(xì)胞群分析(一個(gè)小問題)[http://mp.weixin.qq.com/s...
雖然scanpy有展示marker基因的熱圖函數(shù)(scanpy單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組python教程(五):最詳盡的基礎(chǔ)可視化解析),但是有很明顯的缺陷,...
之前我們推出過單細(xì)胞差異豐度分析的R包miloR(miloR:?jiǎn)渭?xì)胞差異豐度分析)。這個(gè)方法也有python版的實(shí)現(xiàn),github官網(wǎng): htt...