發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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【五年磨一劍】純代碼復(fù)現(xiàn)nature/cell大型網(wǎng)絡(luò)圖并標(biāo)注模塊基因起源于五年前的一篇cell,又被喚醒于2024年的一篇nature medicine。兩篇文章這個(gè)圖都是關(guān)于WGCNA后續(xù)結(jié)果的展示，勝在這個(gè)網(wǎng)...
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【1:1復(fù)刻Cell】python版單細(xì)胞多組差異基因火山圖可視化函數(shù)我們之前在python中1:1復(fù)刻R版火山圖之后（【1:1復(fù)刻R版】python版火山圖函數(shù)一鍵出圖），群里小伙伴希望使用python復(fù)刻之前c...
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【視頻教程】cNMF（Consensus NMF）：基于python的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)非負(fù)矩陣分解分析R版本的NMF分析中，我們介紹了相關(guān)概念，可查看（（視頻教程）NMF: 單細(xì)胞非負(fù)矩陣分解R語(yǔ)言版-數(shù)據(jù)降維及MetaProgram分析）。但是...
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你有這么大的樣本嗎？---學(xué)習(xí)張澤民院士Cell文章分析思路之單細(xì)胞豐度NMF分析2025-08-10起源是我們微信群里的小伙伴發(fā)了一張熱圖，需要讓我復(fù)現(xiàn)，是一篇Cancer cell的文章，因?yàn)槲覀儗戇^很多熱圖，所以對(duì)這個(gè)圖無感，原因是看似復(fù)雜...
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Circular Plot系列(六)：【視頻教程】復(fù)現(xiàn)SCI圖表之環(huán)形圖展示分組celltype基因表達(dá)circle plot精彩系列： Circular Plot系列(一): 環(huán)形熱圖繪制Circular Plot系列(二): 學(xué)習(xí)nature子...
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玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞(21)：復(fù)現(xiàn)Nature圖表---單細(xì)胞亞群無監(jiān)督層次聚類分析及環(huán)形樹狀圖繪制玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞往期精彩系列： 玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞(1)---提取特定基因表達(dá)的細(xì)胞群分析（一個(gè)小問題）[http://mp.weixin.qq.com/s...
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【視頻-python一鍵函數(shù)】：熱圖標(biāo)注特定基因及不同顏色設(shè)置展示marker基因雖然scanpy有展示marker基因的熱圖函數(shù)（scanpy單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組python教程（五）：最詳盡的基礎(chǔ)可視化解析），但是有很明顯的缺陷，...
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milo-基于KNN的差異豐度分析（python版miloR）之前我們推出過單細(xì)胞差異豐度分析的R包miloR（miloR：?jiǎn)渭?xì)胞差異豐度分析）。這個(gè)方法也有python版的實(shí)現(xiàn)，github官網(wǎng): htt...