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2022-10-20 fastq 質量控制結果推斷Q20：質量值為20，表示錯誤率為1/100，正確率99%Q30：質量值為30，表示錯誤率為1/1000，正確率為99.9%phix: 擴增子測...
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【統(tǒng)計與檢驗-4】permutation testpermutation-test 檢驗 置換檢驗(permutation test)是一種非參數檢驗。 在樣本分布未知且數量較小的時，我們一般選...
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【統(tǒng)計與檢驗-3】p-value,q-value and FDR最近數據分析，涉及到了fdr的篩選，參考文章時，文章中選擇了fdr 0.1作為cutoff，但是數據離譜，0.1 作為閾值對于我的數據毫無意義，...
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Rstudio下安裝xlsx rjava安裝r包---xlsx 1.首先需要安裝rjava安裝rjava包時報錯如下： 解決此問題主要是java路徑不對，主要使用以下的方法： 參考鏈接...
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[Metagenome-2]Remove the host sequence
對于宏基因組測序,我們不可避免的會在DNA提取中引入宿主基因組序列,為了避免這些序列的干擾,在進行分析和組裝之前,我們最好先去除宿主基因組,然后...
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[Metagenome-1] Metagenomic Data analysis--summary宏基因組數據分析 宏基因組，和metataxonomics（16s rRNA analysis），是使用全基因組測序技術來研究特定環(huán)境下的所有的...
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【統(tǒng)計與檢驗-2】Mann-Whitney U testMann-Whitney U 檢驗 Mann-Whitney U檢驗:也叫Mann–Whitney–Wilcoxon (MWW), Wilcox...
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【統(tǒng)計與檢驗-1】Shapiro-Wilk檢驗
Shapiro-Wilk檢驗 該檢驗是由S.S.Shapiro與M.B.Wilk提出的，又被稱之為W檢驗，主要檢驗研究對象是否符合正態(tài)分布。假設...