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    單細胞之軌跡分析-2:monocle2 原理解讀+實操

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    2022-10-20 fastq 質(zhì)量控制結(jié)果推斷

    Q20:質(zhì)量值為20,表示錯誤率為1/100,正確率99%Q30:質(zhì)量值為30,表示錯誤率為1/1000,正確率為99.9%phix: 擴增子測序,質(zhì)量控制出現(xiàn)下面的情況,推...

  • @Biofantasy 應(yīng)該是read1和read2標反了,因為根據(jù)bam文件的flag值可以看出來,163 應(yīng)該是 read paired, read mapped in proper pair,second in pair的結(jié)果,所以應(yīng)該是read2 實際是read1,read1實際是read2

    雙端測序中read1和read2的關(guān)系

    ??在跟著健明老師學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的過程中,少走了很多彎路,躲過了很多坑,在指導(dǎo)下淺嘗過一些。但是自己常常扣原理,又雙叒叕落坑,百思不得其解。以下是之前遇到的問題,今天整理帶大...

  • VCF文件格式解析

    VCF文件全稱為Variant Call Format,表示基因組的變異信息,通常為GATK和Samtools軟件處理所得到。VCF文件大致可以分為兩個部分: 1、以##開頭...

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