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    2022-10-20 fastq 質(zhì)量控制結(jié)果推斷

    Q20:質(zhì)量值為20,表示錯(cuò)誤率為1/100,正確率99%Q30:質(zhì)量值為30,表示錯(cuò)誤率為1/1000,正確率為99.9%phix: 擴(kuò)增子測(cè)...

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    【統(tǒng)計(jì)與檢驗(yàn)-4】permutation test

    permutation-test 檢驗(yàn) 置換檢驗(yàn)(permutation test)是一種非參數(shù)檢驗(yàn)。 在樣本分布未知且數(shù)量較小的時(shí),我們一般選...

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    【統(tǒng)計(jì)與檢驗(yàn)-3】p-value,q-value and FDR

    最近數(shù)據(jù)分析,涉及到了fdr的篩選,參考文章時(shí),文章中選擇了fdr 0.1作為cutoff,但是數(shù)據(jù)離譜,0.1 作為閾值對(duì)于我的數(shù)據(jù)毫無(wú)意義,...

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    Rstudio下安裝xlsx rjava

    安裝r包---xlsx 1.首先需要安裝rjava安裝rjava包時(shí)報(bào)錯(cuò)如下: 解決此問(wèn)題主要是java路徑不對(duì),主要使用以下的方法: 參考鏈接...

  • [Metagenome-2]Remove the host sequence

    對(duì)于宏基因組測(cè)序,我們不可避免的會(huì)在DNA提取中引入宿主基因組序列,為了避免這些序列的干擾,在進(jìn)行分析和組裝之前,我們最好先去除宿主基因組,然后...

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    [Metagenome-1] Metagenomic Data analysis--summary

    宏基因組數(shù)據(jù)分析 宏基因組,和metataxonomics(16s rRNA analysis),是使用全基因組測(cè)序技術(shù)來(lái)研究特定環(huán)境下的所有的...

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    【統(tǒng)計(jì)與檢驗(yàn)-2】Mann-Whitney U test

    Mann-Whitney U 檢驗(yàn) Mann-Whitney U檢驗(yàn):也叫Mann–Whitney–Wilcoxon (MWW), Wilcox...

    0.9 45782 9 14 1
  • 【統(tǒng)計(jì)與檢驗(yàn)-1】Shapiro-Wilk檢驗(yàn)

    Shapiro-Wilk檢驗(yàn) 該檢驗(yàn)是由S.S.Shapiro與M.B.Wilk提出的,又被稱之為W檢驗(yàn),主要檢驗(yàn)研究對(duì)象是否符合正態(tài)分布。假設(shè)...

    0.6 56637 10 11 3
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運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué),解讀生命奧秘
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