其實(shí)我轉(zhuǎn)移到了別的平臺(tái)，簡書很久才看一次，評(píng)論看到的時(shí)候基本已經(jīng)過去很多天，另外平時(shí)工作繁忙，很少有功夫回復(fù)。如果是跟我的教程學(xué)習(xí)，有卡住的情況，迫切需要我?guī)椭膯栴}，請(qǐng)參考...
發(fā)簡信
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基于Lasso回歸篩選變量構(gòu)建Cox模型并繪制Nomogram本文轉(zhuǎn)自易學(xué)統(tǒng)計(jì)基于Lasso回歸篩選變量構(gòu)建Cox模型并繪制Nomogram[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzNw...
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R語言 Logistic回歸~模型構(gòu)建
線性回歸模型是研究連續(xù)型變量與一組自變量之間的關(guān)系。也就是說線性回歸模型的因變量是連續(xù)型變量。如果因變量是分類變量，則是非線性的，此時(shí)需要用Logistic回歸，對(duì)其發(fā)生概率...
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R語言 Logistic回歸~變量篩選Logistic回歸預(yù)測模型思路：1.模型構(gòu)建2.模型評(píng)價(jià)3.模型驗(yàn)證 最優(yōu)模型1.模型能夠反映自變量與因變量之間的真實(shí)聯(lián)系2.模型能使用的自變量數(shù)目要盡可能的少 模型構(gòu)建中...
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WGCNA學(xué)習(xí)筆記本篇代碼參考文章:1.生信菜鳥團(tuán)：一文學(xué)會(huì)WGCNA分析2.WGCNA（加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析）3.WGCNA分析，簡單全面的最新教程4.WGCNA實(shí)戰(zhàn)練習(xí)5.STEP6:W...
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臨床預(yù)測模型列線圖的評(píng)估：校準(zhǔn)曲線模型構(gòu)建完成后需要對(duì)模型進(jìn)行評(píng)估和驗(yàn)證其性能。模型預(yù)測的生存率與實(shí)際的差距有多大呢？一般是看校準(zhǔn)曲線。例：一個(gè)模型（其C指數(shù)為0.8）評(píng)估某位患者5年復(fù)發(fā)率為70%。說明該模...
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iMAP: 單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合工具天花板說在前面 Immugent在前段時(shí)間的一篇推文中：SciBet:一個(gè)軟件解決單細(xì)胞注釋所有煩惱[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4Mj...
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生信綜述？帶你解鎖高分單細(xì)胞發(fā)文騷操作！
說在前面 我們都知道在科研論文中有兩大類：一類是研究型論文；另一類是綜述型論文。其中，前者主要是以研究為主的行文思路，根據(jù)研究發(fā)現(xiàn)的不同發(fā)表在不同級(jí)別的雜志上；而后者多是本身...
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GSEA會(huì)用了，來了解下DGSEA？
差異基因集富集分析(DGSEA)是對(duì)Broad Institute / MIT的原始的Gene Set Enrichment Aanlysis（GSEA）分析算法的改進(jìn)。它是...
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轉(zhuǎn)載---[轉(zhuǎn)錄組] 用qPCR驗(yàn)證RNA-Seq挑多少個(gè)基因合適？做完RNA-Seq測序之后，往往會(huì)用QPCR來驗(yàn)證一下結(jié)果。 因?yàn)镽NA-Seq測序數(shù)據(jù)得到的結(jié)果作為定量參考，參數(shù)的改變也會(huì)造成結(jié)果的不同。所以需要進(jìn)行qPCR驗(yàn)證，表達(dá)水...
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比較三種機(jī)器學(xué)習(xí)模型（隨機(jī)森林，支持向量機(jī)，邏輯回歸）的分類效果我把這個(gè)思路搬運(yùn)到我的課題里，復(fù)現(xiàn)圖如下： 相似度：75%。a和b是用AI畫的，所以今天分享下c和d的代碼 一 差異分析 假設(shè)我們有了這樣的一個(gè)表達(dá)矩陣，叫Expr_all。...
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比較隨機(jī)森林（RF）和支持向量機(jī)（SVM）兩種機(jī)器學(xué)習(xí)方法篩選marker能力+ROC曲線繪制最近要中期了，再加上CSC申請(qǐng)即將開始，忙碌而充實(shí)的日子又開始了。忙里偷閑更個(gè)簡書～今天的主題是我課題的一部分，通過五折交叉驗(yàn)證比較隨機(jī)森林（RF）和支持向量機(jī)（SVM）兩種...
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表觀遺傳--RNA甲基化之m6A前沿 表觀遺傳學(xué)，包括組蛋白共價(jià)修飾(covalent histone modification)、DNA甲基化修飾(DNA methylation)、RNA甲基化修飾(RN...
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初學(xué)者R語言：外部數(shù)據(jù)導(dǎo)入一.對(duì)于TXT文件 1.對(duì)于簡單文件，可以簡單讀取，ex1 <- read.table("ex1.txt") 2.對(duì)于復(fù)雜文件，ex1 <-read.table("文件名如e...
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190303 GEO數(shù)據(jù)分析文章熱圖重現(xiàn)
文章Tinagl1 Suppresses Triple-negative Breast Cancer Progression by Simultaneously Target...