@曹草BioInfo 不好意思，這是真的不太懂
二代群體遺傳與重測序（下）五.種群歷史與基因交流 書接上回http://www.itdecent.cn/p/0147afc3334c[http://www.itdecent.cn/p/0147af...
發(fā)簡信
IP屬地：江西
-
-
@曹草BioInfo 你好，我使用mcmc2中的makeMappabilityMask.py進行轉換但是所有的bed.gz里面都是空的，看了很多都沒有說怎么轉換，請問方便提供一下mask.fa文件中需要屏蔽的區(qū)域轉換成bed文件
的腳本嗎？二代群體遺傳與重測序（下）
五.種群歷史與基因交流 書接上回http://www.itdecent.cn/p/0147afc3334c[http://www.itdecent.cn/p/0147af...
-
@吳糖氣泡水_84f9 請問您有解決這個問題嗎？
fastsimcoal2推斷群體演化歷史(Demographic history)
1. 群體演化歷史分析的案例： 群體演化包括有效群體大小(Ne)變化、基因流，遷徙，分化等，會對等位基因頻率產生顯著影響，塑造了現(xiàn)有遺傳多樣性的模式和水平。群體演化、遺傳漂變...
-
@略略略_7c34 你好，請問你解決這個問題了嗎
fastsimcoal2推斷群體演化歷史(Demographic history)
1. 群體演化歷史分析的案例： 群體演化包括有效群體大小(Ne)變化、基因流，遷徙，分化等，會對等位基因頻率產生顯著影響，塑造了現(xiàn)有遺傳多樣性的模式和水平。群體演化、遺傳漂變...
-
你好請問如何由mask.fa文件中需要屏蔽的區(qū)域轉換成bed文件
二代群體遺傳與重測序（下）
五.種群歷史與基因交流 書接上回http://www.itdecent.cn/p/0147afc3334c[http://www.itdecent.cn/p/0147af...
-
samtools和bcftools的安裝Linux只是愛好，生信才是生活。得安裝一些常用的軟件了。 1samtools安裝 需要的包也太多了，希望這些都行都能整一個自動安裝依賴包的功能，或者像gcc那樣，附帶個腳本...
-
@bililililili 你好，請問你有重構轉錄本嗎？我也在想，如果我對發(fā)現(xiàn)新基因不感興趣，是不是就可以直接比對、bam排序之后，進行計算FKPM了。
關于stringtie定量基因的時候，最后輸出很多MSTRG樣式的geneid
相信大家在用hisat2-stringtie-DESeq2這一套流程做差異表達基因分析的時候的時候，最后會輸出很多帶MSTRG字樣的geneid。 我一開始搜索這個問題，...
-
@China與天兒 您好，請問您解決這個問題了嗎？
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析
一、安裝軟件 1、HISAT2 將reads比對到基因組上 2、StringTie 將比對好的reads進行拼裝并預計表達水平 3、SAM tools 課上已經用sudo a...
-
@李五四 您好，請問您解決了嗎？
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析
一、安裝軟件 1、HISAT2 將reads比對到基因組上 2、StringTie 將比對好的reads進行拼裝并預計表達水平 3、SAM tools 課上已經用sudo a...