@曹草BioInfo 不好意思，這是真的不太懂
二代群體遺傳與重測(cè)序（下）五.種群歷史與基因交流 書(shū)接上回http://www.itdecent.cn/p/0147afc3334c[http://www.itdecent.cn/p/0147af...
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@曹草BioInfo 你好，我使用mcmc2中的makeMappabilityMask.py進(jìn)行轉(zhuǎn)換但是所有的bed.gz里面都是空的，看了很多都沒(méi)有說(shuō)怎么轉(zhuǎn)換，請(qǐng)問(wèn)方便提供一下mask.fa文件中需要屏蔽的區(qū)域轉(zhuǎn)換成bed文件
的腳本嗎？二代群體遺傳與重測(cè)序（下）
五.種群歷史與基因交流 書(shū)接上回http://www.itdecent.cn/p/0147afc3334c[http://www.itdecent.cn/p/0147af...
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@吳糖氣泡水_84f9 請(qǐng)問(wèn)您有解決這個(gè)問(wèn)題嗎？
fastsimcoal2推斷群體演化歷史(Demographic history)
1. 群體演化歷史分析的案例： 群體演化包括有效群體大小(Ne)變化、基因流，遷徙，分化等，會(huì)對(duì)等位基因頻率產(chǎn)生顯著影響，塑造了現(xiàn)有遺傳多樣性的模式和水平。群體演化、遺傳漂變...
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@略略略_7c34 你好，請(qǐng)問(wèn)你解決這個(gè)問(wèn)題了嗎
fastsimcoal2推斷群體演化歷史(Demographic history)
1. 群體演化歷史分析的案例： 群體演化包括有效群體大小(Ne)變化、基因流，遷徙，分化等，會(huì)對(duì)等位基因頻率產(chǎn)生顯著影響，塑造了現(xiàn)有遺傳多樣性的模式和水平。群體演化、遺傳漂變...
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你好請(qǐng)問(wèn)如何由mask.fa文件中需要屏蔽的區(qū)域轉(zhuǎn)換成bed文件
二代群體遺傳與重測(cè)序（下）
五.種群歷史與基因交流 書(shū)接上回http://www.itdecent.cn/p/0147afc3334c[http://www.itdecent.cn/p/0147af...
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samtools和bcftools的安裝Linux只是愛(ài)好，生信才是生活。得安裝一些常用的軟件了。 1samtools安裝 需要的包也太多了，希望這些都行都能整一個(gè)自動(dòng)安裝依賴包的功能，或者像gcc那樣，附帶個(gè)腳本...
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@bililililili 你好，請(qǐng)問(wèn)你有重構(gòu)轉(zhuǎn)錄本嗎？我也在想，如果我對(duì)發(fā)現(xiàn)新基因不感興趣，是不是就可以直接比對(duì)、bam排序之后，進(jìn)行計(jì)算FKPM了。
關(guān)于stringtie定量基因的時(shí)候，最后輸出很多MSTRG樣式的geneid
相信大家在用hisat2-stringtie-DESeq2這一套流程做差異表達(dá)基因分析的時(shí)候的時(shí)候，最后會(huì)輸出很多帶MSTRG字樣的geneid。 我一開(kāi)始搜索這個(gè)問(wèn)題，...
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@China與天兒 您好，請(qǐng)問(wèn)您解決這個(gè)問(wèn)題了嗎？
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析
一、安裝軟件 1、HISAT2 將reads比對(duì)到基因組上 2、StringTie 將比對(duì)好的reads進(jìn)行拼裝并預(yù)計(jì)表達(dá)水平 3、SAM tools 課上已經(jīng)用sudo a...
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@李五四 您好，請(qǐng)問(wèn)您解決了嗎？
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析
一、安裝軟件 1、HISAT2 將reads比對(duì)到基因組上 2、StringTie 將比對(duì)好的reads進(jìn)行拼裝并預(yù)計(jì)表達(dá)水平 3、SAM tools 課上已經(jīng)用sudo a...