基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡單明了，我這里就不再贅述，大家移步去搞清楚基本知識(shí)。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https://www.genedenov...
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群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細(xì)畫法 -
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生信小白如何在半年收到核心期刊錄用證明順利畢業(yè)?。。。ɑ蚣易宄蓡T的確定）一篇生信家族的文章比較重要的一步是家族成員的確定，所有基本分析和進(jìn)化分析都是基于此。 前面推文提到本人的參考物種是模式植物擬南芥，因此我首先下載了很多關(guān)于擬南芥的綜述類和研究...
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一篇文章學(xué)懂Shell腳本Shell腳本,就是利用Shell的命令解釋的功能，對(duì)一個(gè)純文本的文件進(jìn)行解析，然后執(zhí)行這些功能，也可以說Shell腳本就是一系列命令的集合。Shell可以直接使用在win/...
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GO，KEGG，DO富集分析這是我聽B站鯪魚不會(huì)飛視頻（GO，KEGG，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的，自行忽略.... 市面上公...
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2021-11-16 ggtree包繪制進(jìn)化樹余大神的力作之一：Guangchuang Yu (https://yulab-smu.top[https://yulab-smu.top/])。繪制出的進(jìn)化樹還是很專業(yè)美觀的...
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Linux中批量提取多個(gè)文件指定行至新文件
提取同一文件夾下多個(gè)文件 注意此處不能用單>,因?yàn)?gt;表示先清空文件再寫入。>會(huì)造成只有一個(gè)文件的結(jié)果被保留，所以要用>>
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Bowtie2比對(duì)過程中發(fā)生的一個(gè)小錯(cuò)誤劉小澤寫于2020.5.21記錄一下踩的坑 上報(bào)錯(cuò) 手上有一些ATAC-seq的雙端測序數(shù)據(jù)（25bp）進(jìn)行了fastp質(zhì)控過濾后準(zhǔn)備進(jìn)行比對(duì)，結(jié)果比對(duì)過程發(fā)生報(bào)錯(cuò)，信息如下...
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水稻染色體RNA的質(zhì)控、比對(duì)和計(jì)數(shù)首先要感謝特別特別好說話的師姐和同門的幫助和交流，主要用到的工具是linux和NCBI 然后在整個(gè)過程中也借鑒了jimmy大神的簡書貼子，鏈接：原創(chuàng)10000+生信教程大神給...
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miRNA-seq分析流程參考0[https://cloud.tencent.com/developer/article/1054975]參考1[http://www.itdecent.cn/p/8...
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方便快捷的smallRNA數(shù)據(jù)分析流程前言 ??今天來跟大家分享一個(gè)smallRNA的分析流程——sRNAnalyzer[http://srnanalyzer.systemsbiology.net/]。這個(gè)流程是...
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linux學(xué)習(xí)100篇27:Linux入門背景知識(shí)背景認(rèn)識(shí) Linux的內(nèi)核是由芬蘭人李納斯·托瓦茲編寫的，后來又經(jīng)過全世界各地的程序開發(fā)人員的努力，共同開發(fā)的一款免費(fèi)的操作系統(tǒng)。 操作系統(tǒng)定義：是管理計(jì)算機(jī)硬件資源，控制其...
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單細(xì)胞108篇文獻(xiàn)解讀之15--Single-cell analyses reveal key immune cell subsets associated with response to P...文章信息* 題目：Single-cell analyses reveal key immune cell subsets associated with response t...
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MEGA | 多序列比對(duì)功能1：序列編輯 首先，要講一條使用mega打開序列文件的技巧:直接將要分析的文件拖到mega軟件的圖標(biāo)上，然后就是下面這個(gè)界面了。 在第一列選中序列名稱，就可以對(duì)序列名稱進(jìn)...
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small RNA學(xué)習(xí)（四）：鑒定&注釋產(chǎn)生小RNA的基因1. 使用ShortStack鑒定，注釋產(chǎn)生小RNA的基因 1.1 下載安裝 1.2 下載依賴的軟件（包） perl, samtools, bowtie & bowtie-b...
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small RNA學(xué)習(xí)（三）：參考序列下載0. 背景知識(shí) 非編碼RNA介紹——百度詞條 miRNA的命名規(guī)則： 詳細(xì)介紹見https://mp.weixin.qq.com/s/SnrUB8v0_Mzlg2f4nHju...
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small RNA學(xué)習(xí)（二）：原始數(shù)據(jù)去3'端adapter小RNA測序的數(shù)據(jù)要多看一下adapter。 拿我下載的數(shù)據(jù)來看，reads讀長是51，但小RNA的長度基本都是20多點(diǎn)（21，24），肯定會(huì)把接頭序列也測到。所以在很多地方...
