您好,單拷貝直系同源基因,如果序列后面有*,在序列比對(duì)的時(shí)候,要?jiǎng)h除嗎?因?yàn)槲矣胮rank比對(duì)之后,*變成了X
基于OrthoFinder的結(jié)果提取直系同源單拷貝基因建樹0.運(yùn)行Orthofinder略 1.建樹 https://github.com/yongzhiyang2012/Two_iron_wood_genome_analysis/...
您好,單拷貝直系同源基因,如果序列后面有*,在序列比對(duì)的時(shí)候,要?jiǎng)h除嗎?因?yàn)槲矣胮rank比對(duì)之后,*變成了X
基于OrthoFinder的結(jié)果提取直系同源單拷貝基因建樹0.運(yùn)行Orthofinder略 1.建樹 https://github.com/yongzhiyang2012/Two_iron_wood_genome_analysis/...
Using Biopython to concatenate (aligned) sequences with the same name (yueyvettehao.net...
你好,系統(tǒng)發(fā)育樹有要求嗎?是需要帶有發(fā)育時(shí)間的樹,還是有枝長(zhǎng)的樹就可以
Hyphy,不亞于Paml的選擇壓力分析的優(yōu)秀軟件,使用指北近幾年來(lái),Hyphy的使用人數(shù)越來(lái)越來(lái)多,雖然不及paml,但這款軟件的一些優(yōu)秀特性使得它值得受到使用和關(guān)注。首先相比paml,hyphy有以下幾大優(yōu)點(diǎn): 操作使用簡(jiǎn)單。 運(yùn)...
前幾天,Nucleic Acids Res新發(fā)了一篇文章,關(guān)于查找基因組調(diào)控元件的網(wǎng)頁(yè)在線工具EpiRegio:https://epiregio.de/。 具體來(lái)說(shuō),該工具有...
博主您好,第一行命令里的 singlecopyorthologues.txt是不是orthogroups_SingleCopyOrthologs.txt這個(gè)文件呀?
開放問(wèn)題:如何從OrthoFinder2的Single_Copy_Orthologue_Sequences蛋白序列集提取CDS進(jìn)行正選擇分析已有“OrthoFinder/Results_Jul11/Orthogroups ”
您好,cat *.fa > hg.19.fa 大于號(hào)前面的數(shù)據(jù)是怎么得來(lái)的啊?
2022-04-21fa文件和gff文件提取cds序列并翻譯成蛋白cat *.fa >hg19.fa #根據(jù)hg19.fa提取CDS序列 gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -y t...