IP屬地：陜西
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)01：DNA重復(fù)區(qū)域和二代測(cè)序粗讀了文章中的幾張圖片，整理筆記如下。 DNA重復(fù) 人類(lèi)基因組包含大量DNA重復(fù)區(qū)域： 這些重復(fù)區(qū)域在染色體上分布情況如下： 重復(fù)區(qū)域的比對(duì) 雖...
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R讀取json
rjson讀取json文件的教程自行搜索。 以下為使用記錄： 如果僅僅加載rjson，讀取json文件報(bào)錯(cuò)： 同時(shí)加載jsonlite順利讀取j...
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conda遷移環(huán)境
conda-pack遷移免去安裝軟件的苦惱！具體教程可參考Conda 環(huán)境遷移 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanla...
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16S rRNA16s rRNA結(jié)構(gòu) 大體結(jié)構(gòu)如下： 不同物種高變區(qū)域起始和終止位置稍有不同。 16s rRNA序列提取 根據(jù)gff，基因類(lèi)型只保留rRNA，剔...
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bcftools: error while loading shared libraries: libgsl.so.25: cannot open shared object file: No ...
問(wèn)題 artic（conda安裝）對(duì)新冠三代擴(kuò)增子數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，但是運(yùn)行artic minion流程時(shí)，調(diào)用bcftools出錯(cuò)，內(nèi)容如下： 資...
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Rmarkdown渲染pdf
根據(jù)鏈接[https://zhuanlan.zhihu.com/p/96993644]安裝rticles包，選擇CTeX Documents創(chuàng)建...
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引物比對(duì)
通過(guò)計(jì)算edist距離，如果小于3個(gè)堿基錯(cuò)配，則認(rèn)為識(shí)別到引物。
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核酸熱力學(xué)介紹（DNA）宏基因檢測(cè)病原已有多篇專(zhuān)家共識(shí)陸續(xù)發(fā)表，管理規(guī)定相對(duì)成熟。除了宏基因技術(shù)，多重PCR擴(kuò)增結(jié)合高通量測(cè)序因具有高性?xún)r(jià)比、分析速度快、靈敏度等優(yōu)勢(shì)在...
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decontam原理介紹前言 實(shí)驗(yàn)過(guò)程中，背景細(xì)菌的存在可能導(dǎo)致交叉污染，引起假陽(yáng)性的發(fā)生，從而給mNGS結(jié)果解讀帶來(lái)困擾。mNGS專(zhuān)家共識(shí)中指出，實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該建立背景細(xì)...