這里是佳奧<br><br>有疑問歡迎email或yuque平臺<br><br>專注多組學挖掘基因，以及非模式植物的下游注釋以及可視化工作
發(fā)簡信
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘九：lasso回歸加載表達矩陣和生存數(shù)據(jù) 進行l(wèi)asso回歸，找到最佳建模位置 再用得到的最佳的位置去建模 判斷預測結(jié)果的準確性 后面這段是補充，可以不用看了。。。 最后 感謝jimmy的生信...
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R語言~高級PCA分析主成分分析，不只需要找到幾個虛擬但不知具體為何物的主成分因子，還需要知道我們提供的變量在各個主成分因子上的載荷（有正有負）和貢獻度，以及具體保留多少個主成分因子才能既盡量保留...
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CBNplot：將富集分析結(jié)果和臨床特征相關(guān)聯(lián)說在前面 生信寶庫在之前的兩期推文：CBNplot：可視化富集通路中基因的調(diào)控關(guān)系[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5ODI1...
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【單細胞高級繪圖】07.KEGG富集結(jié)果展示這一節(jié)畫的圖是比較新的，圖中我用紅色箭頭標出的是pathway 注釋信息(big annotation，自己想的，非專有名詞)，縱軸花花綠綠的標注是pathway的 注釋(s...
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單細胞分析之細胞交互-5：NicheNet多組間互作比較常用的細胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.itdecent.cn/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲存受體、配體以及兩種相互作用...
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HRD 同源重組缺陷 基因檢測產(chǎn)品研發(fā)同源重組缺陷，具體概念自己去搜，不想重復。僅以此篇記錄下我這個因架構(gòu)調(diào)整被砍掉的項目（做了這么多年腫瘤相關(guān)的產(chǎn)品開發(fā)，我要做點別的方向啦~做腫瘤做累了），希望能幫助到同樣在開...
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fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam生信分析常見文件格式查看生信分析過程中的文件格式：除了原始測序數(shù)據(jù)fastq、fasta之外，還有基因組文件fasta格式，基因注釋文件gtf格式。在分析的過程中還會有眾多中間文件的生成，如bed、...
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DoHeatmap的優(yōu)化+ComplexHeatmap繪制帶特定基因的單細胞熱圖單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] Seurat是分析單細胞數(shù)據(jù)一個非常好用的包，自帶...
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正則表達式神器，以后再也不用百度了當有項目需求用到正則表達式，你會怎么做？打開百度直接搜索「手機號正則表達式」，復制到 IDE 運行一下看一看符不符合自己的期望？ 是不是常常因為找不到合適的表達式，深惡痛絕。...
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