寫(xiě)在前面 很久很久以前，各種原因，我寫(xiě)過(guò)一個(gè)帖子，《零基礎(chǔ)-完全重現(xiàn)某個(gè)基因家族分析文章（的分析部分）》 http://www.itdecent.cn/p/88075f6c...
IP屬地：黑龍江
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使用HMM進(jìn)行基因家族鑒定？無(wú)人不能。 -
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本科畢業(yè)于浙江大學(xué)，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)，浙大讀博ing。<br>如果沒(méi)有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
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Machine Learning, Big Data, Bioinformatics
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啦啦啦，每天睡到自然醒吧
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Ks值用TBtools計(jì)算不出來(lái)？講一個(gè)故事Ka，Ks（或Dn，Ds），這兩個(gè)值以及他們的比值分別被賦予了一定的生物學(xué)意義。其中最為常用的是兩者的比值，存在這么一種常見(jiàn)認(rèn)知： ka/ks>>1 正選擇 ka/ks~1 ...
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利用tbtools批量計(jì)算KaKs值如上圖需要準(zhǔn)備三個(gè)文件。 1.一個(gè)###必須的###基因?qū)π畔⑽募?，大體格式如下（tab分割）： 2. 一個(gè)##必須的##cds序列文件（其中必須包括要用到的基因?qū)?duì)應(yīng)的CD...
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插件 | 點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)，基因差異表達(dá)分析~幾分鐘就掌握了于是，TBtools - RNAseq 全家桶到位！ 寫(xiě)在前面 很久很久以前，TBtools 解決了 RNAseq 數(shù)據(jù)分析中幾個(gè)常見(jiàn)問(wèn)題： 基因功能注釋，NR，SWISSP...
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基因選擇壓力分析 | Ka/Ks, Dn/Ds 大規(guī)模計(jì)算，更快更準(zhǔn)！寫(xiě)在前面 來(lái)來(lái)去去，這個(gè)主題相關(guān)的，我已經(jīng)寫(xiě)過(guò)很多個(gè)推文，甚至還包括與Raindy（福建農(nóng)林高芳鑾老師）合作開(kāi)發(fā)和發(fā)表了 EasyCodeML。只能說(shuō)，確實(shí)是一個(gè)相對(duì)常見(jiàn)但似...
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