寫在前面 很久很久以前，各種原因，我寫過一個帖子，《零基礎(chǔ)-完全重現(xiàn)某個基因家族分析文章（的分析部分）》 http://www.itdecent.cn/p/88075f6c...
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使用HMM進行基因家族鑒定？無人不能。 -
Ks值用TBtools計算不出來？講一個故事Ka，Ks（或Dn，Ds），這兩個值以及他們的比值分別被賦予了一定的生物學意義。其中最為常用的是兩者的比值，存在這么一種常見認知： ka/ks>>1 正選擇 ka/ks~1 ...
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利用tbtools批量計算KaKs值如上圖需要準備三個文件。 1.一個###必須的###基因?qū)π畔⑽募?，大體格式如下（tab分割）： 2. 一個##必須的##cds序列文件（其中必須包括要用到的基因?qū)?yīng)的CD...
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插件 | 點點點，基因差異表達分析~幾分鐘就掌握了于是，TBtools - RNAseq 全家桶到位！ 寫在前面 很久很久以前，TBtools 解決了 RNAseq 數(shù)據(jù)分析中幾個常見問題： 基因功能注釋，NR，SWISSP...
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基因選擇壓力分析 | Ka/Ks, Dn/Ds 大規(guī)模計算，更快更準！寫在前面 來來去去，這個主題相關(guān)的，我已經(jīng)寫過很多個推文，甚至還包括與Raindy（福建農(nóng)林高芳鑾老師）合作開發(fā)和發(fā)表了 EasyCodeML。只能說，確實是一個相對常見但似...
