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MEGAHIT 微生物 de novo 組裝
在查找了相當(dāng)一部分資料發(fā)現(xiàn)，NEGAHIT對于微生物的無參組裝比較適合，在SOAP denovo官網(wǎng)網(wǎng)頁都有說明。 安裝 使用conda直接安裝...
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kmergenie 安裝及使用由于需要做微生物的De novo無參組裝，查了一些資料發(fā)現(xiàn)大多軟件需要先確定K值，而kmergenie能夠根據(jù)數(shù)據(jù)的得到最佳的K值，下邊記錄一下...
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WGS變異分析后，下游進(jìn)行maftools分析經(jīng)過WGS上游分析之后，會產(chǎn)生類似于樣本對應(yīng)的*_hg38_multianno.txt文件： 然后通過合并txt文件，調(diào)整數(shù)據(jù)，生成一個多樣本融...