WGCNA的官方文檔里有這樣一句話:In the past, we called the module membership values kME.
然后,kME的定義是,kMEbrown(i) = cor(xi, MEbrown)
datKME=signedKME(datExpr, datME, outputColumnName="MM.")
而MM:geneModuleMembership = as.data.frame(cor(datExpr, MEs, use = "p"))
我比較過(guò)這兩個(gè)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)是一模一樣的,所以它們應(yīng)該就是一個(gè)東西,只不過(guò)一個(gè)是用WGCNA內(nèi)置的函數(shù)signedKME()算出來(lái)的,一個(gè)用cor()算的。
wow_w 評(píng)論自WGCNA(6):篩選 hub gene