eggnog-mapper實現(xiàn)功能注釋 eggNOG-Mapper介紹 通常功能注釋的思路都是基于序列相似性找直系同源基因,常見的方法就是BLAST+BLAST2GO, 或者...
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前一篇推送為大家解讀了2019年發(fā)表的PNAS文章,介紹了如何利用兩組時間序列轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)構(gòu)建特定的基因共表達網(wǎng)絡(luò)以及利用這個網(wǎng)絡(luò)可以得到哪些信息。 這一期推送聚焦于具體的分析...
平時我們做柱狀圖或餅圖都會用彩色進行填充,但是文章有時候為了節(jié)約成本采用黑白印刷時候,圖形一般都會做成各種陰影線條填充模式來進行區(qū)分(如下圖),R中的ggpattern包剛好...
總結(jié)了一些平時常用的數(shù)據(jù)處理命令 生信入門 linux實用基礎(chǔ)1 2 3 Linux實用基礎(chǔ)1[http://www.itdecent.cn/p/84f0119f68e5]...
歡迎來GitHub上fork,一起進步: https://github.com/xuzhougeng 比對軟件很多,首先大家去收集一下,因為我們是帶大家入門,請統(tǒng)一用hisa...
hello,大家好,今天我們來實現(xiàn)一下下面的這張熱圖 我們最關(guān)注的就是圖的右邊只標(biāo)記感興趣的基因,如何實現(xiàn)呢??? 準(zhǔn)備作圖文件 接下來,讓我們來實現(xiàn)一下上面的熱圖。 為了繪...
grep grep的基本用法 grep命令是支持正則表達式的一個多用途文本搜索工具,一般格式為 grep 選項 模式 文件 grep命令的模式十分靈活,可以是字符串,也可以是...
今天我又復(fù)習(xí)了之前看的《Metabolic Pathway Design:A Practical Guide》的第一章,運行了書中python包cobra的代碼,我終于了解微...