eggnog-mapper實現功能注釋 eggNOG-Mapper介紹 通常功能注釋的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常見的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者...
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應該是最好的eggnog-mapper功能注釋教程 -
生信分析：兩條件時間序列轉錄組的基因共表達網絡前一篇推送為大家解讀了2019年發(fā)表的PNAS文章，介紹了如何利用兩組時間序列轉錄組數據構建特定的基因共表達網絡以及利用這個網絡可以得到哪些信息。 這一期推送聚焦于具體的分析...
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ggpattern包-基于幾何圖案或圖像的自定義填充平時我們做柱狀圖或餅圖都會用彩色進行填充，但是文章有時候為了節(jié)約成本采用黑白印刷時候，圖形一般都會做成各種陰影線條填充模式來進行區(qū)分(如下圖)，R中的ggpattern包剛好...
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R實用基礎2——常用數據處理命令
總結了一些平時常用的數據處理命令 生信入門 linux實用基礎1 2 3 Linux實用基礎1[http://www.itdecent.cn/p/84f0119f68e5]...
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轉錄組入門（5）： 序列比對歡迎來GitHub上fork，一起進步： https://github.com/xuzhougeng 比對軟件很多，首先大家去收集一下，因為我們是帶大家入門，請統(tǒng)一用hisa...
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文獻中的熱圖代碼實現（熱圖標記感興趣的基因,基礎知識）hello，大家好，今天我們來實現一下下面的這張熱圖 我們最關注的就是圖的右邊只標記感興趣的基因，如何實現呢？？？ 準備作圖文件 接下來，讓我們來實現一下上面的熱圖。 為了繪...
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【shell筆記>命令】grep,sed,awk
grep grep的基本用法 grep命令是支持正則表達式的一個多用途文本搜索工具，一般格式為 grep 選項 模式 文件 grep命令的模式十分靈活，可以是字符串，也可以是...
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【學習筆記】基因組水平的代謝模型今天我又復習了之前看的《Metabolic Pathway Design:A Practical Guide》的第一章，運行了書中python包cobra的代碼，我終于了解微...
