基因家族鑒定分析操作手冊: 基因家族 基因家族鑒定 基因家族鑒定分析總結(jié) 1.下載基因組信息文件,gff,cds,pep,fasta文件: Ensembl下載地址:http:...
最近在學(xué)習(xí)R,主要在看《R語言入門與實踐》這本書(Garrett Grolemund著,馮凌秉譯,人民郵電出版社),做了一些筆記,分享給大家 目錄 這篇筆記的PDF版本:ht...
為了解決四個難題我們設(shè)計開發(fā)了“GSEA簡易分析工具”和” GSEA結(jié)果可視化工具” 01—研究背景 Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分...
1.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備(以CYP450為例)a.CYP450隱馬爾可夫模型(hmm模型)準(zhǔn)備Pfam數(shù)據(jù)庫:http://pfam-legacy.xfam.org/[http://pf...
首先非常感謝CJ老師開發(fā)的TBtools工具,給生信分析帶來了極大的便利,詳細(xì)內(nèi)容介紹請參考http://www.itdecent.cn/p/f39bff6c4746 一 ...
首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具,為生信分析做圖帶來了極大的便利。作為生信小白,在做多物種間共線性分析時,嘗試了多種方法,苦于沒有計算機(jī)基礎(chǔ),一直沒能完成...
當(dāng)通過qpcr驗證基因表達(dá)是否與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)一致,通常通過柱形圖與折線圖疊加的方式呈現(xiàn),今天記錄下步驟。 軟件:Graphpad步驟1.輸入qpcr與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表達(dá)量,格式如下...
寫在前面 不知道大家都是怎么完成qPCR的計算的,在不會R的時候,我是用一個祖?zhèn)鞯腅xcel表進(jìn)行計算的。??但是,一直有個缺點,如果需要計算的量比較大時,就不方便了,去搜了一...
寫在前面 2021年,新年第一天,我在忙著家里事情的間隙,分成五次(每次大概30min),錄制了 TBtools 的熱圖(Heatmap)功能的介紹與參數(shù)詳解。 TBtool...
森嚴(yán)森語: 最近的一些學(xué)習(xí)和經(jīng)歷,讓我產(chǎn)生一種很強烈的認(rèn)知,那就是由于嚴(yán)重缺乏對身邊觸手可及的事物的了解,而導(dǎo)致在學(xué)習(xí)和生活過程中不能產(chǎn)生最大化的生產(chǎn)力。常表現(xiàn)的一種具體的現(xiàn)...
寫在前面 TBtools 基本涵蓋了基因家族分析所常見的所有分析與可視化功能,其中最為獨特的 莫過于 Gene Structure View (Advanced) 幾乎覆蓋了...
寫在前面 對于沒有做過共線性分析的小伙伴,可以通過以下幾段內(nèi)容,了解一下,我為什么要費勁巴拉畫出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
多組學(xué)研究思路以及寫作 非生物脅迫 類型干旱脅迫、鹽脅迫、低溫脅迫、高光/UV-B脅迫、高溫、重金屬、機(jī)械損傷、營養(yǎng)缺乏等 影響地理分布、產(chǎn)量、糧食安全 大牛朱健康、鞏志忠、...