專注WGBS Chipseq等數(shù)據(jù)分析<br>perl python R腳本編輯處理數(shù)據(jù)
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河南
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公眾號(hào) 生信小課堂
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這個(gè)世界流行離開(kāi)，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
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滿足你的碩士畢業(yè)論文小套路---蛋白結(jié)構(gòu)與功能和疾病關(guān)系的生信分析完整套路
目前，許多學(xué)校的碩士畢業(yè)論文要求都是發(fā)表一篇中文核心論文，便能達(dá)到畢業(yè)小論文考核。針對(duì)小論文的發(fā)表，有的同學(xué)要么是因?yàn)檎n題難度有些大，沒(méi)有摸好合適的濃度，實(shí)驗(yàn)結(jié)果不理想。...
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這部分包含很多內(nèi)容，且有的很長(zhǎng)。 現(xiàn)在不會(huì)再去翻譯這些插件等的使用了 或許就是當(dāng)時(shí)翻譯就是為了以后不翻譯
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Coexpression network Differential coexpressio network Protein interaction network functional interaction network transcriptional regulatoty network ceRNA network
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TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘
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玩轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄組分析，你也可以的！
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Notch信號(hào)傳導(dǎo)通路Notch信號(hào)傳導(dǎo)通路是決定細(xì)胞命運(yùn)的最重要的通路之一。Notch通路比較復(fù)雜，主要由四部分組成：Notch受體、Notch配體、CSLDNA結(jié)合蛋白、下游靶基因。其中任何一...
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R語(yǔ)言利用轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)矩陣做基因共表達(dá)分析的學(xué)習(xí)資料推薦參考資料鏈接 https://github.com/cxli233/SimpleTidy_GeneCoEx/tree/v1.0.1[https://github.com/cx...
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請(qǐng)問(wèn)一下老師，單個(gè)基因集的GSEA分析，流程跟多個(gè)基因集的一樣嗎，我跑不出來(lái)結(jié)果
【R>>ssGSEA】制作GSEA需要的gmt文件
GSEA文件有8類基因集，基本上可以解決80%-90%用到的問(wèn)題，當(dāng)然，我們都還有個(gè)性化需求，這個(gè)時(shí)候就需要我們自己動(dòng)手啦。先來(lái)觀察下GSEA需要的gmt文件格式(h.all...
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歡迎關(guān)注公眾號(hào) “生信交流平臺(tái)”
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自噬相關(guān)基因集合前面小編給大家介紹過(guò)幾個(gè)研究熱點(diǎn)相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
