發(fā)簡(jiǎn)信
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PBS腳本 提交任務(wù)1.創(chuàng)建PBS腳本 #如何在linux下創(chuàng)建一個(gè)可運(yùn)行shell腳本 #新建一個(gè).sh文件 touch cellranger.count.sh #編輯test.sh文件 vi...
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動(dòng)物數(shù)量遺傳學(xué)博士<br>主要研究方向：表型值預(yù)測(cè)，數(shù)量遺傳, 生物信息分析<br>工作語(yǔ)言：R，Python, shell<br><br>不要百分百相信此博客！??！全部基于個(gè)人理解，如果錯(cuò)誤，請(qǐng)幫忙指正?。。?lt;br>PS:下面有微信公眾號(hào)開始同步推送此博客內(nèi)容
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躺著舒服嗎？那是留給死人的~<br>（一個(gè)憑興趣嘮嗑的本科生）<br>簡(jiǎn)書不更新了，在我自己的網(wǎng)站<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2F118.31.35.204%2F" target="_blank">http://118.31.35.204/</a>更新
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GWAS數(shù)據(jù)分析
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Smart is the new Sexy
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一些生物信息學(xué)用到的軟件，工具，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測(cè)序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對(duì)比如blast、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對(duì)比如mega、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 ?? 尋找測(cè)序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測(cè)序質(zhì)量評(píng)估的FastQC、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測(cè)序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
