寫的不錯
可汗學院統(tǒng)計學學習筆記（1）1-16集本系列文章為可汗學院統(tǒng)計學的公開課筆記，視頻地址：http://open.163.com/special/Khan/khstatistics.html視頻講的很入門淺顯，挺好...
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load(file = "kegg_info.RData")，1: In readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) :
truncating string with embedded nuls
2: file ‘kegg_info.RData’ has magic number 'X'
Use of save versions prior to 2 is deprecated，怎么解決呢？生信 | 構建物種的OrgDb
寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.itdecent.cn/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機[https://www.jiansh...
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生信 | 構建物種的OrgDb寫在前面 本文主要參考生信小白2018[http://www.itdecent.cn/p/bb4281e6604e]與多啦A夢的時光機[https://www.jiansh...
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R讀取數(shù)據出現(xiàn)“l(fā)ine 1 appears to contain embedded nulls”的解決方法
由于數(shù)據可能在Windows下編輯過，保存的是UTF-16的格式用R讀取可能會出現(xiàn)以下問題。這種情況有以下三種解決方案。 解決方法一：fileEncoding="UTF16L...
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ubuntu 18.04 安裝中文輸入法我們的 Linux 漫游之旅已經開始有那么幾天了，在前面的文章中，如果你一路跟下來的話，我相信現(xiàn)在你的電腦打開已經和別人的不一樣了。你的同學、朋友、同事看到你的電腦都會問你一...
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RNASeq實戰(zhàn)練習-hisat2比對與featurecounts定量
hisat2 構建索引 hisat2 比對 hisat2 比對軟件將 reads 比對到參考基因組[http://www.itdecent.cn/p/e9cebbd8ef5...
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Qiime1-17.PICRUSt-16S預測宏基因組？
16S擴增子測序是對細菌中具有代表性的序列進行測序，相比宏基因組測序，16S擴增子測序無法提供基因功能信息，只能給出菌群豐度信息。但是PICRUSt工具可以幫助我們基于16S...
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--p-trim-left 截取左端低質量序列，我們看上圖中箱線圖，左端質量都很高，無低質量區(qū)，設置為0；你說的這句話 ，你圖在哪呢
2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列質控和生成特征表
文字轉載 DADA2是用于檢測和校正（如果有可能的話）Illumina擴增序列數(shù)據的工作流程。正如在q2-dada2插件中實現(xiàn)的，這個質量控制過程將過濾掉在測序數(shù)據中鑒定的任...
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--p-trim-left 0 \
--p-trunc-len 120 \ 這到底用多少合適呢2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列質控和生成特征表
文字轉載 DADA2是用于檢測和校正（如果有可能的話）Illumina擴增序列數(shù)據的工作流程。正如在q2-dada2插件中實現(xiàn)的，這個質量控制過程將過濾掉在測序數(shù)據中鑒定的任...
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運行： python /home/yxa/workspace/zhuanluzuyuanshuju/BMK_DATA_20230512141746_1/Data/figaro/figaro/figaro.py -i /home/yxa/workspace/zhuanluzuyuanshuju/BMK_DATA_20230512141746_1/Data/data -o /home/yxa/workspace/zhuanluzuyuanshuju/BMK_DATA_20230512141746_1/Data/data -f 1 -r 1 -a 465 -F zymo。出現(xiàn)了：python Forward read files appear to be of different lengths or of varied lengths. {(247, 1.9094949494949496), (247, 1.5660606060606062), (246, 1.9485858585858586), (246, 1.732929292929293), (247, 2.4722222222222223), (247, 2.050909090909091), (247, 2.0277777777777777), (247, 2.0105050505050506), (247, 2.04040404040404), (247, 2.0832323232323233), (246, 1.8273737373737373), (247, 1.538989898989899), (247, 1.6832323232323234), (247, 1.8824242424242423), (247, 1.6262626262626263), (246, 1.4475757575757575), (246, 1.4791919191919192), (247, 1.8460606060606062), (246, 1.9191919191919191)}求大佬幫忙
微生物多樣性qiime2分析流程(3) 使用figaro來得到dada2正反向截斷參數(shù)
dada2插件對原始數(shù)據paired-end-demux.qza進行質量過濾需要兩個參數(shù)，trunc-len-f和trunc-len-r。這個想法是通過盡可能多地刪除較低質量...
