Salmon 是轉(zhuǎn)錄本定量軟件，使用轉(zhuǎn)錄本定量主要優(yōu)點一是更準(zhǔn)確，比如不同樣本同一基因使用不同 isoform 此時基因長度并不相等，直接基因定量無法顧及；二是方便進(jìn)行可變剪...
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Salmon 進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本定量 -
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連鎖不平衡（LD）分析。在群體遺傳學(xué)研究中，LD連鎖不平衡分析是非常常見的內(nèi)容，同時也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)。在很多的遺傳進(jìn)化GWAS的文章中都會出現(xiàn)LD衰減或者block單倍型塊的圖。那么什么是連鎖不平...
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群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-測序技術(shù)學(xué)習(xí)
重測序技術(shù)簡介 全基因組重測序(Resequencing)是對已知參考基因組序列的物種進(jìn)行不同個體間的基因組測序，并在此基礎(chǔ)上對個體或群體進(jìn)行差異性分析。通過全基因組重測序，...
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央視一出手，就是讓人跪著看完的8.8分神片
近些年，“盜墓片”一直是熱門。 只是電視劇、電影、網(wǎng)劇一部接一部地出，卻沒有哪一部能叫好又叫座。 直到前不久，知醬發(fā)現(xiàn)了央視操刀的8.8分紀(jì)錄片——《?；韬睢贰?短短三集，吊...
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GWAS，SNP，和疾病
三種方法如何獲取snp信息 引用: http://www.bio-info-trainee.com/2100.html#more-2100 有研究表明STAT4上的rs757...
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在拿到研究生畢業(yè)證前，我的一切都是導(dǎo)師的“我26歲跟著導(dǎo)師讀博，他當(dāng)時剛評上教授，今年我32了，他也評上了‘杰青’。在他看來這是國家對他的肯定，可在我看來，這里面流淌著我們師兄弟無數(shù)個日日夜夜的血汗！” 1 201...
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R與RStudio的安裝1.什么是R R是用于統(tǒng)計分析、繪圖的語言和操作環(huán)境。R是屬于GNU系統(tǒng)的一個自由、免費、源代碼開放的軟件，它是一個用于統(tǒng)計計算和統(tǒng)計制圖的優(yōu)秀工具。簡單來說，R是一門統(tǒng)計計...
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2018-10-11 使用plink1.9 和plink2 把 vcf 轉(zhuǎn)化成bed bim fam
上次我是把bed bim fam 轉(zhuǎn)成 vcf ，這次反過來，我已有的vcf 文件，要轉(zhuǎn)成 bed bim fam. 上網(wǎng)查了查，發(fā)現(xiàn)plink1.9 和 plink2.0 ...
