泛素和泛素化介紹 泛素 泛素為含76個氨基酸、大小約為8.6 kDa的小蛋白質(zhì)，在真核生物中普遍存在且高度保守。人類基因組中的四個基因編碼泛素：UBB，UBC，UBA52和R...
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蛋白質(zhì)經(jīng)泛素-蛋白酶體降解研究基本思路（圖文詳解） -
你考慮過computeMatrix的工作原理么?寫在前面的話 你既然點進來了，說明你多半用過這個軟件。但我猜，大多數(shù)人早期使用這個軟件的時候，一定是趕鴨子上架：因為要畫圖，所以必須會。 但你真的懂了么？ 太長不看系列 對于...
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統(tǒng)計學(xué)回顧（精華目錄收藏）（statquest+協(xié)和八+ NGSHotpot）
文章轉(zhuǎn)自生信技能樹，喜歡多多關(guān)注喲！ 原創(chuàng)： 生信技能樹 如果你不想錯過我們的精彩教程，請置頂我們：沒看到通知？是不是五行缺星？ 如果你不想漏掉我們往期教程，請學(xué)會搜索：歷史...
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轉(zhuǎn)錄組中的基因表達模式聚類分析
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! 實驗設(shè)計對于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析是非常重要的，對于常規(guī)的case/control實驗設(shè)計，通過兩組間的差異檢驗就可以得到不同條件下的差異基因；對于多組...
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如果是雙端測序結(jié)果應(yīng)該怎么設(shè)置ChIP-seq或ATAC-seq的參數(shù)呢？
MACS2為ATAC-seq callpeak
ATAC-seq作為檢測基因組開放位置的重要手段，被越來越多的使用。而其call peak的方法也有很多，這里我們介紹的是MACS。MACS最初被發(fā)表是用于ChIP-seq ...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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生信小工具: Bedtools使用教程(1)
最近要處理一些基因注釋的文件，要用到bedtools這款經(jīng)典的軟件，在慢慢接觸到這款軟件才發(fā)現(xiàn)其功能的強大之處，在接下來的幾個星期內(nèi)將會大家一起入門并且學(xué)習(xí)掌握使用bedto...
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【百文】【文獻通讀】The Pioneer Transcription Factor FoxA Maintains an Accessible Nucleosome Configuration ...
Author：Makiko Iwafuchi-Doi, Greg Donahue, Akshay Kakumanu, ..., Dolim Lee, Klaus H. Kae...
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macs2 callpeak 的統(tǒng)計學(xué)原理
來源于其他大神的其他資源，僅作為自己筆記備份以便后續(xù)查看 macs2 raw paper:https://genomebiology.biomedcentral.com/ar...
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【百文】【文獻通讀】Pioneer factor Foxa2 enables ligand-dependent activation of LXRαJessica Kain, Xialong Wei, Andrew J Price, Claire Woods, Irina BochkisType II nuclear h...
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不寫代碼，在線工具轉(zhuǎn)換各種格式gene id一個一個gene id轉(zhuǎn)換太麻煩，用這兩個網(wǎng)站，事半功倍：DAVID：https://david.ncifcrf.gov/home.jspbioDBnet：https://b...
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討厭又迷人的reads去重復(fù)在NGS分析入門階段，我們不需要考慮太多的細節(jié)，只用知道一個分析的大致流程并完整跑下來即可。太多的細節(jié)，只會讓我們對于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼，因此一些“無關(guān)緊要“細節(jié)就被我們刻...
