一、背景 有的時候，我們需要手動對結(jié)果文件(可能是vcf，xls，或者其他形式)進行bed文件的過濾，這時候如何高效準確的對posi是否在目標區(qū)域內(nèi)，成為關(guān)鍵。 二、關(guān)鍵點 ...
發(fā)簡信
IP屬地：內(nèi)蒙古
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使用二分查找進行bed區(qū)域過濾
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我比較懶沒往下寫，李金明先生主編的《高通量測序技術(shù)》一書有細節(jié)，你要是愿意看的話，給我留個言，我都更新上
菜鳥搭建有參轉(zhuǎn)錄組分析流程
文章參考于李金明先生主編的《高通量測序技術(shù)》一書 一、樣本的選擇 本次的樣本來源于小鼠8個不同的組織（每個組織兩個重復(fù)） 數(shù)據(jù)來源于SRA數(shù)據(jù)庫（PRJNA177791）樣本...
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網(wǎng)易企業(yè)郵箱如何配置foxmailFoxmail是電腦中非常好用的郵件管理軟件，但對網(wǎng)易企業(yè)郵箱顯得并不友好，經(jīng)常嘗試多次也無法成功配置。終于我廢了九牛二虎之力，成功了，現(xiàn)在滿含激動的淚水，和大家分享一下。 ...
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《利用Python進行數(shù)據(jù)分析·第2版》第1章 準備工作《利用Python進行數(shù)據(jù)分析·第3版》新版上市[https://u.jd.com/W8xSkzl]，新版使用的是Pandas 1.4，更新了不少內(nèi)容。為了幫助大家學(xué)習(xí)，這次...
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Sanger 測序，NGS 測序，數(shù)據(jù)分析
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RNA-seq 檢測變異之 GATK 最佳實踐流程
tags： RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比對 對 RNA-seq 產(chǎn)出的數(shù)據(jù)進行變異檢測分析，與常規(guī)重測序的主要區(qū)別就在序列比...
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一個在人工智能路上不斷探索的搬磚工。
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RNA-seq: Kallisto+Sleuth(1)本文我們來簡單介紹一下非常快捷好用的一個RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推薦的原因是其速度非?？?，在我的Mac Pro就可以運行使用，而且其結(jié)果也比...
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我就單個樣本用delly filter過濾過，一弄就是空空如也，O(∩_∩)O哈哈~
CNV calling | DELLY
基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis，檢測結(jié)構(gòu)變異。 寫在前面 Delly is an integrated ...
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CNV calling | DELLY基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis，檢測結(jié)構(gòu)變異。 寫在前面 Delly is an integrated ...
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如何下載TCGA數(shù)據(jù)/TCGA數(shù)據(jù)下載小教程1. 什么是TCGA？TCGA中有哪些數(shù)據(jù)？ TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個項目始于2005年，它旨在使用基因測序和生物信息學(xué)編目與癌...
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SnpEff 配置基因組注釋文件
SnpEff 軟件提供了絕大多數(shù)物種的基因組注釋信息，但隨著基因組版本的不斷更新和新的更好的基因組的出現(xiàn)，我們有時需要將新的參考基因組注釋信息添加到其本地數(shù)據(jù)集中，本文是我再...
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