總結(jié)一下目前學(xué)習(xí)的，基于Rstudio的創(chuàng)建R包流程。 Part1：創(chuàng)建R包基本流程 step1：建立R包開(kāi)發(fā)環(huán)境 目的是創(chuàng)建一個(gè)文件夾，用于儲(chǔ)存編寫(xiě)R包的各種文檔；在創(chuàng)建之...
發(fā)簡(jiǎn)信
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R-編寫(xiě)R包-入門(mén)篇 -
R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)線性擬合知識(shí)清單 lm函數(shù) lm對(duì)象的屬性及回歸直線各值的調(diào)用 改變坐標(biāo)軸和坐標(biāo)軸加箭頭 限制abline和其他作圖函數(shù)的作圖范圍 1. lm函數(shù) formula代表擬合的公式，如Y...
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scRNAseq || 堆疊小提琴圖(StackedVlnPlot)的4種實(shí)現(xiàn)方式??最近一直在學(xué)習(xí)單細(xì)胞方面的知識(shí)，無(wú)意中看到別人的帖子在分享如何畫(huà)堆疊的小提琴圖(StackedVlnPlot)，順便就學(xué)習(xí)了一下。發(fā)現(xiàn)StackedVlnPlot圖確實(shí)看...
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ggplot2高效實(shí)用指南寫(xiě)在前面 ggplot2 是一個(gè)功能強(qiáng)大且靈活的R包 ，由Hadley Wickham 編寫(xiě)，其用于生成優(yōu)雅的圖形。ggplot2中的gg 表示圖形語(yǔ)法（Grammar o...
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ChIP-seq基礎(chǔ)入門(mén)理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平，我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫(xiě)的問(wèn)題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問(wèn)題是基因在不...
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基因表達(dá)分析（上）- 差異表達(dá)分析基因表達(dá) 什么是基因表達(dá)，如下是來(lái)自于維基百科的解釋： 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂，所以就放幾段百度百科和維基百科的定義。 百度百科 定量PCR（即時(shí)聚合酶鏈鎖反應(yīng)...
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R獲取芯片平臺(tái)與注釋【檢索】
劉小澤寫(xiě)于18.9.12處理芯片數(shù)據(jù)離不開(kāi)注釋包，并且不同的芯片數(shù)據(jù)使用不同的注釋。知道GSE號(hào)后就能知道GPL平臺(tái)號(hào)，但是怎么把平臺(tái)和注釋信息聯(lián)系起來(lái)是個(gè)問(wèn)題。今天花個(gè)十幾...
