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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操 -
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合-1：Harmony原理介紹和官網(wǎng)教程目錄：1. 原理介紹2. 操作演示3. 關(guān)于Harmony操作是否會對差異分析產(chǎn)生影響 1. 原理介紹 官網(wǎng)：https://github.com/immunogenomic...
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一鍵解決不同物種間的直系同源基因的轉(zhuǎn)換一鍵解決不同物種間的直系同源基因的轉(zhuǎn)換 今天推薦一個數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站，可以直接在網(wǎng)站上進(jìn)行轉(zhuǎn)換，比如我們就知道果蠅這個物種，他們自己的名字名命就是和別的物種不一樣，總有一些自己的叫...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組流程一：安裝運(yùn)行cellranger及結(jié)果解讀
單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細(xì)胞的小伙伴對Cell Ranger這個軟件都不陌生，我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法。Cell R...
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【轉(zhuǎn)錄組07】樣本表達(dá)分布、相關(guān)性分析&差異表達(dá)分析一.樣本表達(dá)分布 箱式圖 小提琴圖 概率密度分布圖 以上三個圖結(jié)合起來可以看總體樣本表達(dá)分布圖 二.樣本的相關(guān)性 層次聚類樹————通過計算點(diǎn)與點(diǎn)之間的空間距離對樣本進(jìn)行類別...
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STEP6:WGCNA相關(guān)性分析因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等。...
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【畫圖】pheatmap多圖組合1. 解決問題 ??在進(jìn)行多圖繪制的時候，用cowplot::plot_grid函數(shù)進(jìn)行多圖組合，結(jié)果在多圖組合的時候，別的ggplot畫圖的對象沒有任何問題，但是pheat...
