發(fā)簡信
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利用aspera工具下載SRA數(shù)據(jù)參考鏈接：http://bioinfostar.com/2017/12/23/How-to-download-SRA-data-zh_CN/[h...
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NGS數(shù)據(jù)比對(duì)之BWABWA[http://bio-bwa.sourceforge.net/]主要是將reads比對(duì)到大型基因組上，主要功能是：序列比對(duì)。首先為大型參...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 TrimmomaticNGS 原始數(shù)據(jù)過濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率。Trimmomatic 是一個(gè)功能強(qiáng)大的數(shù)據(jù)過濾軟件...
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NGS數(shù)據(jù)fastq質(zhì)量檢測之FastQC拿到數(shù)據(jù)后我們首先進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估，常用工具為FastQC[https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/pr...
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R語言繪圖——條形圖/柱狀圖直方圖又稱柱狀圖/條形圖，用來展示連續(xù)數(shù)據(jù)分布的常用工具，用來估計(jì)數(shù)據(jù)的概率分布。 1.利用hist()函數(shù)繪制 使用格式：hist(x,bre...
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R語言繪圖——散點(diǎn)圖今天學(xué)習(xí)繪制散點(diǎn)圖，重點(diǎn)是利用ggplot繪制 散點(diǎn)圖對(duì)于顯示兩個(gè)連續(xù)變量之間的關(guān)系最有用 1.利用最簡單的plot工具繪制 使用格式 plo...
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R語言入門學(xué)習(xí)4——列表
列表（list）是一種特別的對(duì)象集合，該形式結(jié)構(gòu)相比矩陣和數(shù)據(jù)框較為復(fù)雜，但是其允許復(fù)雜的各元素，因此可以儲(chǔ)存許多復(fù)雜信息。as.list() ...
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R語言入門學(xué)習(xí)3——矩陣
1.矩陣生成 matrix()函數(shù)as.matrix() 將對(duì)象強(qiáng)制轉(zhuǎn)換為矩陣is.matrix()判斷對(duì)象是否為矩陣matrix(data =...
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R語言繪圖——數(shù)據(jù)可視化ggplot2 介紹和主要的參數(shù)R 有幾種用于制作圖形的系統(tǒng)，但 ggplot2 是最優(yōu)雅和最通用的系統(tǒng)之一。與大多數(shù)其他圖形包不同，ggplot2 具有基于圖形語法的底層語法...