在上一篇文章中，介紹了利用gffread進行g(shù)ff和gtf的格式轉(zhuǎn)換，但是會丟失一些信息，比如UTR，因此這篇文章將介紹另一種方法，AGAT。gff格式與gtf格式轉(zhuǎn)換——g...
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gff格式與gtf格式轉(zhuǎn)換——NBISweden / AGAT -
全長轉(zhuǎn)錄本SSR預(yù)測
SSR-簡單重復(fù)序列預(yù)測（MISA） MISA是使用 perl 編寫的一支程序，能識別出序列中的微衛(wèi)星和復(fù)合微衛(wèi)星（兩個微衛(wèi)星之間由由不多于100bp的堿基對隔開），并給出其...
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基因結(jié)構(gòu)注釋（2）：同源注釋同源預(yù)測(homology prediction)利用近緣物種已知基因進行序列比對，找到同源序列。然后在同源序列的基礎(chǔ)上，根據(jù)基因信號如剪切信號、基因起始和終止密碼子對基因結(jié)...
