在上一篇文章中，介紹了利用gffread進行gff和gtf的格式轉換，但是會丟失一些信息，比如UTR，因此這篇文章將介紹另一種方法，AGAT。gff格式與gtf格式轉換——g...
IP屬地：山東
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gff格式與gtf格式轉換——NBISweden / AGAT -
全長轉錄本SSR預測
SSR-簡單重復序列預測（MISA） MISA是使用 perl 編寫的一支程序，能識別出序列中的微衛(wèi)星和復合微衛(wèi)星（兩個微衛(wèi)星之間由由不多于100bp的堿基對隔開），并給出其...
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基因結構注釋（2）：同源注釋同源預測(homology prediction)利用近緣物種已知基因進行序列比對，找到同源序列。然后在同源序列的基礎上，根據基因信號如剪切信號、基因起始和終止密碼子對基因結...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負了努力
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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請問文中的transposon_blast_parse.pl在哪里找啊
「基因組注釋」構建重復序列數據庫
本文參考自Repeat Library Construction-Advanced，整體思路一致，但是所用軟件有所不同。 流程主要分析MITE和LTR，先根據其結構特征進行注...
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西澳大學生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學的挖掘<br><br>簡信不回答問題，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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