在上一篇文章中，介紹了利用gffread進(jìn)行g(shù)ff和gtf的格式轉(zhuǎn)換，但是會(huì)丟失一些信息，比如UTR，因此這篇文章將介紹另一種方法，AGAT。gff格式與gtf格式轉(zhuǎn)換——g...
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gff格式與gtf格式轉(zhuǎn)換——NBISweden / AGAT -
全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本SSR預(yù)測(cè)
SSR-簡(jiǎn)單重復(fù)序列預(yù)測(cè)（MISA） MISA是使用 perl 編寫(xiě)的一支程序，能識(shí)別出序列中的微衛(wèi)星和復(fù)合微衛(wèi)星（兩個(gè)微衛(wèi)星之間由由不多于100bp的堿基對(duì)隔開(kāi)），并給出其...
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基因結(jié)構(gòu)注釋（2）：同源注釋同源預(yù)測(cè)(homology prediction)利用近緣物種已知基因進(jìn)行序列比對(duì)，找到同源序列。然后在同源序列的基礎(chǔ)上，根據(jù)基因信號(hào)如剪切信號(hào)、基因起始和終止密碼子對(duì)基因結(jié)...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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請(qǐng)問(wèn)文中的transposon_blast_parse.pl在哪里找啊
「基因組注釋」構(gòu)建重復(fù)序列數(shù)據(jù)庫(kù)
本文參考自Repeat Library Construction-Advanced，整體思路一致，但是所用軟件有所不同。 流程主要分析MITE和LTR，先根據(jù)其結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行注...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡(jiǎn)信不回答問(wèn)題，有問(wèn)題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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