單細胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細胞的小伙伴對Cell Ranger這個軟件都不陌生,我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法。Cell R...
單細胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細胞的小伙伴對Cell Ranger這個軟件都不陌生,我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法。Cell R...
先記錄一下,我安裝過程的慘痛經(jīng)歷??,希望小伙伴們避免像我一樣入坑。起初每一次安裝,不論是使用conda還是pip工具,發(fā)現(xiàn)安裝好的CellphoneDB(4.0.0)在she...
我安裝了一天之后快哭了,然后去100塊買了個老師指導生信自學要么哭要么花錢,就是我這個垃圾1、安裝https://github.com/ventolab/CellphoneD...
CellphoneDB工具通過利用我們的CellphoneDB數(shù)據(jù)庫中與單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)交互的分子,提供不同的方法來評估不同細胞類型之間的細胞間通訊。 v5 的新特性 新的P...
常用的細胞通訊軟件:CellphoneDB[http://www.itdecent.cn/p/38a9376f5286]:是公開的人工校正的,儲存受體、配體以及兩種相互作用...
hello,大家好,又是周五,一周又將過去了,時間總是匆匆,片刻不停留,我們唯一能做的,就是在時間流逝的過程中,留下點印記,雖然我們窮,找不下對象,但是過的開心也是成功~~~...
單細胞繪圖系列: Seurat繪圖函數(shù)總結[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
日常瞎掰 ??通過標題大家已經(jīng)知道今天我們分享的主要內(nèi)容了。DoHeatmap這個函數(shù)來自于Seurat包,處理過單細胞的人應該都知道這個函數(shù)就是用來畫每個cluster的m...