單細胞分析流程之Cell Ranger 相信做單細胞的小伙伴對Cell Ranger這個軟件都不陌生，我們今天就來了解一下Cell Ranger的安裝和使用方法。Cell R...
IP屬地：遼寧
-
單細胞轉(zhuǎn)錄組流程一：安裝運行cellranger及結果解讀
-
適用于scRNA-seq的細胞通訊工具-1：CellphoneDB先記錄一下，我安裝過程的慘痛經(jīng)歷??，希望小伙伴們避免像我一樣入坑。起初每一次安裝，不論是使用conda還是pip工具，發(fā)現(xiàn)安裝好的CellphoneDB（4.0.0）在she...
-
cellphoneDB嘔心瀝血下載安裝教程
我安裝了一天之后快哭了，然后去100塊買了個老師指導生信自學要么哭要么花錢，就是我這個垃圾1、安裝https://github.com/ventolab/CellphoneD...
-
CellphoneDB V5CellphoneDB工具通過利用我們的CellphoneDB數(shù)據(jù)庫中與單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)交互的分子，提供不同的方法來評估不同細胞類型之間的細胞間通訊。 v5 的新特性 新的P...
-
單細胞分析之細胞交互-1：CellphoneDB常用的細胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.itdecent.cn/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲存受體、配體以及兩種相互作用...
-
10X空間轉(zhuǎn)錄組分析之空間模式與共定位hello，大家好，又是周五，一周又將過去了，時間總是匆匆，片刻不停留，我們唯一能做的，就是在時間流逝的過程中，留下點印記，雖然我們窮，找不下對象，但是過的開心也是成功~~~...
-
-
DoHeatmap的優(yōu)化+ComplexHeatmap繪制帶特定基因的單細胞熱圖單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
-
DoHeatmap畫熱圖時應該注意的點日常瞎掰 ??通過標題大家已經(jīng)知道今天我們分享的主要內(nèi)容了。DoHeatmap這個函數(shù)來自于Seurat包，處理過單細胞的人應該都知道這個函數(shù)就是用來畫每個cluster的m...
