????R剛?cè)腴T的時(shí)候，能夠正確讀取單個(gè)文件就覺得小有成就，隨著時(shí)間的積累，單一文件地讀取已經(jīng)不能滿足需求了，此時(shí)，批量地做就是解放雙手地過程。 使用for循環(huán)把下載地TCG...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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【R語言】批量讀取某路徑下文件內(nèi)容
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Kaplan-Meier生存分析的結(jié)果解讀和繪制方法1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一種單因素生存分析，它可用于研究1個(gè)因素對(duì)于生存時(shí)間的影響。參考：生存分析之Kaplan-Meier曲線都告...
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更新R和R包
三個(gè)月前R 4.0版本就已經(jīng)正式上線了，之前怕麻煩就一直沒更新，而現(xiàn)在由于要用到新版本的R包，才想起順便一起更新了R。 目前在官網(wǎng)上的最新版R是2020-06-22的4.0....
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R循環(huán)追加數(shù)據(jù)到數(shù)據(jù)框
list轉(zhuǎn)化為data.frame ??在數(shù)據(jù)處理過程中會(huì)遇到各式各樣的要求，格式轉(zhuǎn)換、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)重構(gòu)等需求可以說是家常便飯了，所以R語言本身也提供了很多數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換的函數(shù)或者...
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WGD（全基因組復(fù)制）分析——Ka/Ks及4Dtv值計(jì)算一、4Dtv（四倍簡(jiǎn)并位點(diǎn)顛換率）的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
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GATK DepthOfCoverage 太慢DepthOfCoverage會(huì)輸出7個(gè)文本結(jié)果。其中一個(gè)是按照interval上的每個(gè)堿基，輸出一行統(tǒng)計(jì)信息，所以會(huì)比較慢： .DepthOfCoverage.txt結(jié)果 ...
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GenVisR 基因組數(shù)據(jù)可視化實(shí)戰(zhàn)(二)上一篇講了GenVisR 基因組數(shù)據(jù)可視化實(shí)戰(zhàn) (一)[http://www.itdecent.cn/p/bb695b053246]是GenVisR畫waterfall 圖...
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2018-09-24 wes流程文件解讀2
上次我們整理到bwa比對(duì)后得到bam文件，下一步我們要通過GATK流程從bam文件中call variant。一、使用GATK前須知事項(xiàng)： 對(duì)GATK的測(cè)試主要使用的是人類全...
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R語言 Mutate家族首先是加載相關(guān)的包，mutate主要屬于dplyr包里，這里我們統(tǒng)一使用tidyverse包。tidyverse包中含有各種數(shù)據(jù)整理以及畫圖的包，如下加載tidyverse包...
