背景 雙親高度雜合（親本由多個(gè)單體型構(gòu)成）的分離群體利用常規(guī)的BSA分析方法往往結(jié)果并不理想，因?yàn)樵诨斐刂杏卸嗟任换虻母蓴_。OcBSA就通過(guò)解析兩個(gè)雜合親本的4條單體型在后...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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BSA分析（八）——OcBSA -
BSA分析（六）——QTLseqr包前言 我在猶豫是否補(bǔ)充一篇怎樣拆分染色體進(jìn)行比對(duì)和變異檢測(cè)（主要是為了提高比對(duì)和變異檢測(cè)效率）的帖子。開(kāi)始沒(méi)有規(guī)劃這篇內(nèi)容的原因有兩點(diǎn)：一是內(nèi)容比較簡(jiǎn)單，覺(jué)得可能用處不大；二...
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R語(yǔ)言 -- customLayout 包 拼圖目標(biāo) 使用R拼出這樣的一張圖： Let's start 1. 安裝 customLayout 包 簡(jiǎn)單介紹一下 customLayout 包： lay_new(mat, wi...
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利用重測(cè)序數(shù)據(jù)Call SNP,并嘗試構(gòu)建遺傳圖譜
#構(gòu)建ref genome index file bwa index genome.fasta genome vim sam_file.sh#!/usr/bin/envbas...
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使用MAKER進(jìn)行基因注釋(高級(jí)篇之GeneMark-ET模型訓(xùn)練）GeneMarkGeorgia Institute of Technology開(kāi)發(fā)的一系列基因預(yù)測(cè)工具。真核生物基因組預(yù)測(cè)主要會(huì)用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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Biopython （一）安裝與介紹
被朋友安利一個(gè)專門用于處理生物信息學(xué)的工具箱“Biopython”，別人用python開(kāi)發(fā)的小工具直接拿來(lái)用用也是很省時(shí)省力的，好吧，學(xué)生信就從“調(diào)包俠”開(kāi)始做起吧！ 因?yàn)閯?..
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eQTL歸納幾篇eQTL相關(guān)文章。 1.轉(zhuǎn)自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是數(shù)量性狀位點(diǎn)，比如身高是一個(gè)...
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使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫(xiě)的R包，看過(guò)了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無(wú)法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測(cè)試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一、...
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clusterProfiler導(dǎo)入失敗解決辦法最近在安裝光叔的clusterProfiler包時(shí)，遇到了以下報(bào)錯(cuò)： 即可以正常安裝，但不能導(dǎo)入。 顯示錯(cuò)誤：package or namespace load faile...
