使用ALLHiC基于HiC數(shù)據(jù)輔助基因組組裝 基因組組裝大致可以分為三步(1)根據(jù)序列之間的重疊情況構(gòu)建出contig,(2)基于二代的mate pair文庫(kù)或光學(xué)圖譜將co...
使用ALLHiC基于HiC數(shù)據(jù)輔助基因組組裝 基因組組裝大致可以分為三步(1)根據(jù)序列之間的重疊情況構(gòu)建出contig,(2)基于二代的mate pair文庫(kù)或光學(xué)圖譜將co...
利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析時(shí),發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上沒(méi)有物種包OrgDb,利用網(wǎng)上教程構(gòu)建了一個(gè)。主要參考了劉小澤的簡(jiǎn)書(shū),特別感謝一下?。?! emapper首先得到注釋...
最近在看遺傳數(shù)據(jù)與表達(dá)結(jié)合的東西,介紹一個(gè)經(jīng)典的方法吧,fusion。 Gusev et al. “Integrative approaches for large-scal...
安裝所需要的R包 加載所需的R包,并將默認(rèn)主題設(shè)置為theme_bw(),并將圖例放在圖的頂部 創(chuàng)建一些基本圖像: patchwork包水平拼接 垂直布局可以通過(guò)向plot_...
之前有一次,我導(dǎo)說(shuō)“能不能把這些基因按順序畫(huà)在果蠅的染色體上”,因此,我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法。經(jīng)過(guò)一番奇奇怪怪的操作之后,最終用ggplot2畫(huà)了。。。其它方法簡(jiǎn)單地...
流行病學(xué)研究常見(jiàn)的分析就是相關(guān)性分析了。 相關(guān)性分析某種程度上可以為我們提供一些研究思路,比如缺乏元素A與某種癌癥相關(guān),那么我們可以通過(guò)補(bǔ)充元素A來(lái)減少患癌率。這個(gè)結(jié)論的大前...
前言 我還未想到這個(gè)專題叫什么...... 暫定“XXX就那樣”? 我們先來(lái)個(gè)斗雞眼,看著一下中間的QT。 1.什么是數(shù)量性狀?(quantitative trait,QT)...
1.R包的下載(R version 3.6) 如果R版本是老版本的,請(qǐng)查看網(wǎng)站Bioconductor release的要求進(jìn)行R包下載。注:具體怎么在R中進(jìn)行操作在以下網(wǎng)站...
首先我是這是我日常逛 twitter 看到的,然后我又是一個(gè)搬運(yùn)工( emmm,這個(gè)系列都沒(méi)有詢問(wèn)作者意見(jiàn),后面如果有意外就刪了。 ) 書(shū)籍在線版:R for Data Sc...