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發(fā)簡信
IP屬地：湖南
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生信 | 構(gòu)建物種的OrgDb -
@kkkkkkang LOC1077……是基因id，但query是蛋白id啊
非模式生物本生煙草 (Nicotiana benthamiana) GO/KEGG富集分析 | 轉(zhuǎn)錄組
AnnotationHub中沒有本生煙草數(shù)據(jù)庫，只好自己構(gòu)建，再利用Y叔的clusterProfiler包做富集分析了。首先參考非模式生物富集分析[https://mp.we...
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您好，我想問一下您用的這個本生煙草蛋白序列的蛋白標識符并不能找到對應(yīng)的gene id，您是怎么處理的？這個建庫所用的eggnog輸出的query_name是Niben101Scf03816g02010.1等這些，但是我的需要分析的差異基因的gene id是LOC1077……之類的，然后我想把蛋白id轉(zhuǎn)化為gene id，但我發(fā)現(xiàn)Niben101Scf03816g02010.1在NCBI上無法查到，且用uniprot也無法找到，因此無法轉(zhuǎn)換，請問您是怎么做的呢？非常期待能得到您的指點！
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我要偷偷內(nèi)卷，然后驚艷所有人！
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成功！太感謝了！
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求代碼！??
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您好，可以分享一下煙草注釋數(shù)據(jù)庫的建庫方法嗎，我在建煙草數(shù)據(jù)庫的時候遇到很多困難，太難了??
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